Refining genotype–phenotype correlations in 304 patients with autosomal recessive polycystic kidney disease and PKHD1 gene variants
Kathrin Burgmaier
(1)
,
Leonie Brinker
(1)
,
Florian Erger
(1)
,
Bodo Beck
(1)
,
Marcus Benz
,
Carsten Bergmann
(2)
,
Yilmaz Tabel
,
Hulya Nalcacioglu
,
Olivia Boyer
,
Laure Collard
,
Claudia Dafinger
(1)
,
Marc Fila
(3, 4)
,
Claudia Kowalewska
,
Bärbel Lange-Sperandio
(5)
,
Laura Massella
(6)
,
Antonio Mastrangelo
(7)
,
Djalila Mekahli
(8)
,
Monika Miklaszewska
,
Nadina Ortiz-Bruechle
(9)
,
Ludwig Patzer
,
Larisa Prikhodina
,
Bruno Ranchin
(10)
,
Nadejda Ranguelov
(11)
,
Raphael Schild
(12)
,
Tomas Seeman
(13)
,
Lale Sever
(14)
,
Przemyslaw Sikora
(15)
,
Maria Szczepanska
(16)
,
Ana Teixeira
(17)
,
Julia Thumfart
(18)
,
Barbara Uetz
(13)
,
Lutz Thorsten Weber
(1)
,
Elke Wühl
(19)
,
Klaus Zerres
(9)
,
Escape Study Group
,
Gpn Study Group
,
Jörg Dötsch
(1)
,
Franz Schaefer
(19)
,
Max Christoph Liebau
(1)
,
Aregpkd Consortium
,
Loai Akram Eid
,
Klaus Arbeiter
,
Nathalie Godefroid
,
Jacques Lombet
,
Aurélie de Mul
,
Markus Feldkoetter
,
Jakub Zieg
,
Franziska Grundmann
,
Matthias Galiano
,
Björn Buchholz
,
Anja Buescher
,
Karsten Häffner
,
Oliver Gross
,
Jun Oh
,
Dieter Haffner
,
Wanja Bernhardt
,
Susanne Schaefer
,
Simone Wygoda
,
Jan Halbritter
,
Ute Derichs
,
Günter Klaus
,
Felix Lechner
,
Sabine Ponsel
,
Jens König
,
Hagen Staude
,
Donald Wurm
,
Martin Bald
,
Michaela Gessner
,
Neveen Soliman
,
Gema Ariceta
,
Juan David Gonzalez Rodriguez
,
Francisco de La Cerda Ojeda
,
Jerome Harambat
,
Denis Morin
(3, 20)
,
Claire Dossier
,
Guillaume Dorval
,
Rukshana Shroff
,
Stella Stabouli
,
Nakysa Hooman
,
Francesca Mencarelli
,
William Morello
,
Germana Longo
,
Francesco Emma
,
Augustina Jankauskiene
,
Katarzyna Taranta-Janusz
,
Ilona Zagozdzon
,
Katarzyna Zachwieja
,
Malgorzata Stanczyk
,
Beata Bienias
,
Mieczyslaw Litwin
,
Aurelia Morawiec-Knysak
,
Alberto Caldas Afonso
,
Oliver Dunand
,
Andreea Rachisan
,
Gordana Miloševski-Lomić
,
Svetlana Papizh
,
Rina Rus
,
Houweyda Jilani
,
Bahriye Atmis
,
Ali Duzova
,
Alper Soylu
,
Cengiz Candan
,
Salim Caliskan
,
Alev Yilmaz
,
İbrahim Gökce
,
Nurver Akinci
,
Sevgi Mir
,
Ismail Dursun
1
University Hospital of Cologne [Cologne]
2 University Hospital Freiburg
3 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
4 UM - Université de Montpellier
5 University-Hospital Munich-Großhadern [München]
6 IRCCS Ospedale Pediatrico Bambino Gesù = Bambino Gesù Children’s Hospital
7 Fondazione IRCCS Ca' Granda - Ospedale Maggiore Policlinico
8 University Hospitals Leuven [Leuven]
9 UKA - Universitätsklinikum RWTH Aachen - University Hospital Aachen [Aachen, Germany]
10 HCL - Hospices Civils de Lyon
11 UCL - Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain
12 UKE - Universitaetsklinikum Hamburg-Eppendorf = University Medical Center Hamburg-Eppendorf [Hamburg]
13 Dr von Hauner Children's Hospital [Munich, Germany]
14 Istanbul University
15 Medical University of Lublin
16 SUM - Medical University of Silesia
17 Centro Hospitalar do Porto
18 Charité - UniversitätsMedizin = Berlin University Medicine
19 Heidelberg University Hospital [Heidelberg]
20 IGF - Institut de Génomique Fonctionnelle
2 University Hospital Freiburg
3 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
4 UM - Université de Montpellier
5 University-Hospital Munich-Großhadern [München]
6 IRCCS Ospedale Pediatrico Bambino Gesù = Bambino Gesù Children’s Hospital
7 Fondazione IRCCS Ca' Granda - Ospedale Maggiore Policlinico
8 University Hospitals Leuven [Leuven]
9 UKA - Universitätsklinikum RWTH Aachen - University Hospital Aachen [Aachen, Germany]
10 HCL - Hospices Civils de Lyon
11 UCL - Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain
12 UKE - Universitaetsklinikum Hamburg-Eppendorf = University Medical Center Hamburg-Eppendorf [Hamburg]
13 Dr von Hauner Children's Hospital [Munich, Germany]
14 Istanbul University
15 Medical University of Lublin
16 SUM - Medical University of Silesia
17 Centro Hospitalar do Porto
18 Charité - UniversitätsMedizin = Berlin University Medicine
19 Heidelberg University Hospital [Heidelberg]
20 IGF - Institut de Génomique Fonctionnelle
Marcus Benz
- Fonction : Auteur
Yilmaz Tabel
- Fonction : Auteur
Hulya Nalcacioglu
- Fonction : Auteur
Olivia Boyer
- Fonction : Auteur
- PersonId : 889775
- ORCID : 0000-0002-3957-1359
- IdRef : 11556134X
Laure Collard
- Fonction : Auteur
Claudia Kowalewska
- Fonction : Auteur
Monika Miklaszewska
- Fonction : Auteur
Ludwig Patzer
- Fonction : Auteur
Larisa Prikhodina
- Fonction : Auteur
Escape Study Group
- Fonction : Auteur
Gpn Study Group
- Fonction : Auteur
Aregpkd Consortium
- Fonction : Auteur
Loai Akram Eid
- Fonction : Auteur
Klaus Arbeiter
- Fonction : Auteur
Nathalie Godefroid
- Fonction : Auteur
Jacques Lombet
- Fonction : Auteur
Aurélie de Mul
- Fonction : Auteur
Markus Feldkoetter
- Fonction : Auteur
Jakub Zieg
- Fonction : Auteur
Franziska Grundmann
- Fonction : Auteur
Matthias Galiano
- Fonction : Auteur
Björn Buchholz
- Fonction : Auteur
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Karsten Häffner
- Fonction : Auteur
Oliver Gross
- Fonction : Auteur
Jun Oh
- Fonction : Auteur
Dieter Haffner
- Fonction : Auteur
Wanja Bernhardt
- Fonction : Auteur
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- Fonction : Auteur
Simone Wygoda
- Fonction : Auteur
Jan Halbritter
- Fonction : Auteur
Ute Derichs
- Fonction : Auteur
Günter Klaus
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Felix Lechner
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Sabine Ponsel
- Fonction : Auteur
Jens König
- Fonction : Auteur
Hagen Staude
- Fonction : Auteur
Donald Wurm
- Fonction : Auteur
Martin Bald
- Fonction : Auteur
Michaela Gessner
- Fonction : Auteur
Neveen Soliman
- Fonction : Auteur
Gema Ariceta
- Fonction : Auteur
Juan David Gonzalez Rodriguez
- Fonction : Auteur
Francisco de La Cerda Ojeda
- Fonction : Auteur
Jerome Harambat
- Fonction : Auteur
Claire Dossier
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Guillaume Dorval
- Fonction : Auteur
Rukshana Shroff
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Stella Stabouli
- Fonction : Auteur
Nakysa Hooman
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Francesca Mencarelli
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William Morello
- Fonction : Auteur
Germana Longo
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Augustina Jankauskiene
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Katarzyna Taranta-Janusz
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Ilona Zagozdzon
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Malgorzata Stanczyk
- Fonction : Auteur
Beata Bienias
- Fonction : Auteur
Mieczyslaw Litwin
- Fonction : Auteur
Aurelia Morawiec-Knysak
- Fonction : Auteur
Alberto Caldas Afonso
- Fonction : Auteur
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- Fonction : Auteur
Andreea Rachisan
- Fonction : Auteur
Gordana Miloševski-Lomić
- Fonction : Auteur
Svetlana Papizh
- Fonction : Auteur
Rina Rus
- Fonction : Auteur
Houweyda Jilani
- Fonction : Auteur
Bahriye Atmis
- Fonction : Auteur
Ali Duzova
- Fonction : Auteur
Alper Soylu
- Fonction : Auteur
Cengiz Candan
- Fonction : Auteur
Salim Caliskan
- Fonction : Auteur
Alev Yilmaz
- Fonction : Auteur
- PersonId : 816325
- ORCID : 0000-0003-1743-1491
- IdRef : 258178590
İbrahim Gökce
- Fonction : Auteur
Nurver Akinci
- Fonction : Auteur
Sevgi Mir
- Fonction : Auteur
Ismail Dursun
- Fonction : Auteur
Résumé
Autosomal recessive polycystic kidney disease (ARPKD) is a severe disease of early childhood that is clinically characterized by fibrocystic changes of the kidneys and the liver. The main cause of ARPKD are variants in the PKHD1 gene encoding the large transmembrane protein fibrocystin. The mechanisms underlying the observed clinical heterogeneity in ARPKD remain incompletely understood, partly due to the fact that genotype-phenotype correlations have been limited to the association of biallelic null variants in PKHD1 with the most severe phenotypes. In this observational study we analyzed a deep clinical dataset of 304 patients with ARPKD from two independent cohorts and identified novel genotype-phenotype correlations during childhood and adolescence. Biallelic null variants frequently show severe courses. Additionally, our data suggest that the affected region in PKHD1 is important in determining the phenotype. Patients with two missense variants affecting amino acids 709-1837 of fibrocystin or a missense variant in this region and a null variant less frequently developed chronic kidney failure, and patients with missense variants affecting amino acids 1838-2624 showed better hepatic outcome. Variants affecting amino acids 2625-4074 of fibrocystin were associated with poorer hepatic outcome. Thus, our data expand the understanding of genotype-phenotype correlations in pediatric ARPKD patients and can lay the foundation for more precise and personalized counselling and treatment approaches.