Les recherches sur le terrain sont essentielles pour comprendre les interactions entre les variations climatiques et la réponse de la biodiversité locale. La mise en place de protocoles de suivis standardisés à long terme des indicateurs climatiques et biologiques est nécessaire. En lien avec des données plus générales disponibles des observatoires naturalistes régionaux, elles seront la base de la caractérisation et des projections des impacts du changement climatique sur l’état de la biodiversité. Sur le territoire de la région Nouvelle-Aquitaine, une vingtaine d’indicateurs « sentinelles du climat » et des indicateurs météorologiques ont été développés dans 5 écosystèmes particulièrement sensibles de types dunaire, sec, humide, forestier et montagnard. Des plans d’échantillonnage des indicateurs ont été élaborés en 2016. L’année 2017 a été consacrée aux tests des protocoles scientifiques de suivis de la flore et de la faune sur 251 sites à travers la région qui ont été suivis jusqu’en 2021. Les premiers résultats exploratoires ont permis l’expérimentation des plans d’analyse et l’ajustement, l’optimisation des protocoles pour fournir des suivis scientifiques robustes à long terme. Cet ouvrage présente ces protocoles de suivis standardisés pour les indicateurs suivants : 1)la flore et les végétations des milieux sec, humide, montagnard et forestier ; 2)les insectes : 1- les lépidoptères des pelouses sèches, de landes humides et des pelouses de montagne, avec deux études spécifiques pour les espèces Phengaris alcon et Parnassius apollo ; 2- les Leucorrhines et cortège d’odonates associé des lagunes des Landes de Gascogne ; 3- Gomphocerus sibiricus et le cortège des orthoptères associé des prairies et pelouses de montagne des Pyrénées-Atlantiques ; 3)les amphibiens : Hyla molleri des lagunes du triangle landais ; Hyla arborea des mares des landes et du bocage Picto-Limousin ; Rana pyrenaica des torrents de montagne ; 4)les reptiles : Timon lepidus des dunes grises du littoral aquitain ; Zootoca vivipara des landes humides et tourbières de Nouvelle-Aquitaine ; Iberolacerta bonnali et les lézards gris des affleurements et éboulis rocheux de montagne ; Vipera berus et les vipères des landes humides d’altitude ; 5)les mammifères : Marmota marmota des pelouses et rocailles pyrénéennes. Les objectifs de la mise en place de ces protocoles sont : 1) d’établir un état de référence de 2016 à 2021 des populations animales et végétales par la récolte de données protocolées pour les générations futures, 2) de constituer un réseau de surveillance des réponses des espèces face au changement climatique sur le long terme sur 10, 20 voire 30 ans.