Contribution to Alzheimer's disease risk of rare variants in TREM_2, SORL_1, and ABCA_7 in 1779 cases and 1273 controls - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Neurobiology of Aging Année : 2017

Contribution to Alzheimer's disease risk of rare variants in TREM_2, SORL_1, and ABCA_7 in 1779 cases and 1273 controls

1 RID-AGE - Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167
2 Excellence Laboratory LabEx DISTALZ
3 GPMCND - Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques
4 Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène environnement sur la santé des populations
5 INSERM Research Center for Epidemiology and Biostatistics (U897) Team Neuroepidemiology, Bordeaux, France College of Health Sciences, University of Bordeaux, Bordeaux, France
6 Metacohorts Consortium
7 Service de neurologie [Rouen]
8 CNG - Centre National de Génotypage
9 McGill University and Genome Quebec Innovation Centre
10 CHRU Lille - Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille]
11 TCDV - Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U 1171 - EA 1046
12 Département de neurologie [Lille]
13 Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)
14 UB - Université de Bordeaux
15 INSERM, Team Psycoépidémiologie du Vieillissement et des Maladies Chroniques - Population Health Center
16 ITX - ITX - unité de recherche de l'institut du thorax
17 Epidémiologie, santé publique et développement
18 Neuroépidémiologie
19 GGB - Génétique, génomique fonctionnelle et biotechnologies (UMR 1078)
20 Université de Lille
21 Troubles cognitifs vasculaires et dégénératifs
22 Institut Pasteur de Lille
23 Department of Research, Centre hospitalier du Rouvray, Sotteville-lès-Rouen, France
24 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
25 Département de neurologie [Montpellier]
26 CHU Amiens-Picardie
27 LNFP - Laboratoire de Neurosciences Fonctionnelles et Pathologies - UR UPJV 4559
Anne Boland
Robert Olaso
Christophe Tzourio
Jean-François Deleuze
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1015006
Didier Hannequin
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 842408
Philippe Amouyel
Jean-Charles Lambert
Pierre Labauge

Résumé

We performed whole-exome and whole-genome sequencing in 927 late-onset Alzheimer disease (LOAD) cases, 852 early-onset AD (EOAD) cases, and 1273 controls from France. We assessed the evidence for gene-based association of rare variants with AD in 6 genes for which an association with such variants was previously claimed. When aggregating protein-truncating and missense-predicted damaging variants, we found exome-wide significant association between EOAD risk~and rare variants in SORL1, TREM2, and ABCA7. No exome-wide significant signal was obtained in the LOAD sample, and significance of the order of 10$^{-6}$ was observed in the whole AD group for TREM2. Our study confirms previous gene-level results for TREM2, SORL1, and ABCA7 and provides a~clearer insight into the classes of rare variants involved. Despite different effect sizes and~varying~cumulative minor allele frequencies, the rare protein-truncating and missense-predicted~damaging variants in TREM2, SORL1, and ABCA7 contribute similarly to the heritability of EOAD and explain between 1.1% and 1.5% of EOAD heritability each, compared with 9.12% for APOE $\varepsilon$4.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-01760388 , version 1 (30-07-2018)

Identifiants

Citer

Céline Bellenguez, Camille Charbonnier, Benjamin Grenier-Boley, Olivier Quenez, Kilan Le Guennec, et al.. Contribution to Alzheimer's disease risk of rare variants in TREM_2, SORL_1, and ABCA_7 in 1779 cases and 1273 controls. Neurobiology of Aging, 2017, 59, pp.220.e1-220.e9. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2017.07.001⟩. ⟨hal-01760388⟩
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