A roadmap for the Human Developmental Cell Atlas - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Nature Année : 2021

A roadmap for the Human Developmental Cell Atlas

Muzlifah Haniffa (1, 2, 3) , Deanne Taylor (4) , Sten Linnarsson (5) , Bruce Aronow (6) , Gary Bader (7) , Roger Barker (8) , Pablo Camara (9) , J. Gray Camp (10) , Alain Chédotal (11) , Andrew Copp (12) , Heather Etchevers (13) , Paolo Giacobini (14) , Berthold Göttgens (8) , Guoji Guo (15) , Ania Hupalowska (16) , Kylie James , Emily Kirby (17) , Arnold Kriegstein (18) , Joakim Lundeberg (19) , John Marioni (20) , Kerstin Meyer (3) , Kathy Niakan (21) , Mats Nilsson (22) , Bayanne Olabi (2) , Dana Pe’er (23) , Aviv Regev (16) , Jennifer Rood (16) , Orit Rozenblatt-Rosen (16) , Rahul Satija (24) , Sarah Teichmann (3) , Barbara Treutlein (25) , Roser Vento-Tormo (3) , Simone Webb (2) , Pascal Barbry (26) , Omer Bayraktar (3) , Sam Behjati (3) , Andreas Bosio , Bruno Canque (27) , Frédéric Chalmel (28) , Yorick Gitton (11) , Deborah Henderson (2) , Anne Jorgensen (29) , Steven Lisgo (2) , Jinyue Liu (30) , Emma Lundberg (31) , Jean-Léon Maitre (32) , Séverine Mazaud-Guittot (28) , Elizabeth Robertson (33) , Antoine D. Rolland (28) , Raphael Scharfmann (34) , Michèle Souyri (35) , Erik Sundström (36) , Stéphane Zaffran (13) , Matthias Zilbauer (8, 36)
1 Institute of Cellular Medicine [Newcastle]
2 Newcastle University [Newcastle]
3 The Wellcome Trust Sanger Institute [Cambridge]
4 CHOP - Children’s Hospital of Philadelphia
5 Karolinska Institutet [Stockholm]
6 Cincinnati Children's Hospital Medical Center
7 University of Toronto
8 CAM - University of Cambridge [UK]
9 Perelman School of Medicine
10 Unibas - Université de Bâle = University of Basel = Basel Universität
11 Institut de la Vision
12 Institute of Child Health [London]
13 MMG - Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille
14 LilNCog - Lille Neurosciences & Cognition - U 1172
15 Zhejiang University [Hangzhou, China]
16 BROAD INSTITUTE - Broad Institute of MIT and Harvard
17 McGill University = Université McGill [Montréal, Canada]
18 UC San Francisco - University of California [San Francisco]
19 KTH - KTH Royal Institute of Technology [Stockholm]
20 CRUK - Cancer Research UK Cambridge Institute [Cambridge, Royaume-Uni]
21 The Francis Crick Institute [London]
22 Stockholm University
23 Memorial Sloane Kettering Cancer Center [New York]
24 NYU - New York University [New York]
25 ETH Zürich - Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology [Zürich]
26 IPMC - Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire
27 HIPI (UMR_S_976 / U976) - Immunologie humaine, physiopathologie & immunothérapie
28 Irset - Institut de recherche en santé, environnement et travail
29 UCPH - University of Copenhagen = Københavns Universitet
30 GIS - Genome Institute of Singapore
31 Science for Life Laboratory [Solna]
32 Institut Curie [Paris]
33 University of Oxford
34 IC UM3 (UMR 8104 / U1016) - Institut Cochin
35 (UMR_S1131 / U1131) - Hématopoïèse normale et pathologique : émergence, environnement et recherche translationnelle [Paris]
36 Karolinska Institute
Muzlifah Haniffa
  • Fonction : Auteur correspondant
  • PersonId : 1139821

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Institute of Cellular Medicine [Newcastle]
Newcastle University [Newcastle]
The Wellcome Trust Sanger Institute [Cambridge]
Deanne Taylor
Children’s Hospital of Philadelphia
Sten Linnarsson
Karolinska Institutet [Stockholm]
Bruce Aronow
Cincinnati Children's Hospital Medical Center
Gary Bader
University of Toronto
Roger Barker
  • Fonction : Auteur
University of Cambridge [UK]
Pablo Camara
  • Fonction : Auteur
Perelman School of Medicine
J. Gray Camp
Université de Bâle = University of Basel = Basel Universität
Alain Chédotal
Institut de la Vision
Andrew Copp
Institute of Child Health [London]
Heather Etchevers
Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille
CV
Paolo Giacobini
Lille Neurosciences & Cognition - U 1172
Berthold Göttgens
University of Cambridge [UK]
Guoji Guo
Zhejiang University [Hangzhou, China]
Ania Hupalowska
  • Fonction : Auteur
Broad Institute of MIT and Harvard
Kylie James
  • Fonction : Auteur
Emily Kirby
  • Fonction : Auteur
McGill University = Université McGill [Montréal, Canada]
Arnold Kriegstein
University of California [San Francisco]
Joakim Lundeberg
KTH Royal Institute of Technology [Stockholm]
John Marioni
Cancer Research UK Cambridge Institute [Cambridge, Royaume-Uni]
Kerstin Meyer
The Wellcome Trust Sanger Institute [Cambridge]
Kathy Niakan
The Francis Crick Institute [London]
Mats Nilsson
Stockholm University
Bayanne Olabi
  • Fonction : Auteur
Newcastle University [Newcastle]
Dana Pe’er
Memorial Sloane Kettering Cancer Center [New York]
Aviv Regev
Broad Institute of MIT and Harvard
Jennifer Rood
Broad Institute of MIT and Harvard
Orit Rozenblatt-Rosen
Broad Institute of MIT and Harvard
Rahul Satija
New York University [New York]
Sarah Teichmann
The Wellcome Trust Sanger Institute [Cambridge]
Barbara Treutlein
Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology [Zürich]
Roser Vento-Tormo
The Wellcome Trust Sanger Institute [Cambridge]
Simone Webb
Newcastle University [Newcastle]
Pascal Barbry
Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire
Omer Bayraktar
  • Fonction : Auteur
The Wellcome Trust Sanger Institute [Cambridge]
Sam Behjati
  • Fonction : Auteur
The Wellcome Trust Sanger Institute [Cambridge]
Andreas Bosio
  • Fonction : Auteur
Bruno Canque
  • Fonction : Auteur
Immunologie humaine, physiopathologie & immunothérapie
Frédéric Chalmel
Institut de recherche en santé, environnement et travail
Yorick Gitton
  • Fonction : Auteur
Institut de la Vision
Deborah Henderson
  • Fonction : Auteur
Newcastle University [Newcastle]
Anne Jorgensen
  • Fonction : Auteur
University of Copenhagen = Københavns Universitet
Steven Lisgo
Newcastle University [Newcastle]
Jinyue Liu
  • Fonction : Auteur
Genome Institute of Singapore
Emma Lundberg
  • Fonction : Auteur
Science for Life Laboratory [Solna]
Jean-Léon Maitre
  • Fonction : Auteur
Institut Curie [Paris]
Séverine Mazaud-Guittot
Institut de recherche en santé, environnement et travail
Elizabeth Robertson
  • Fonction : Auteur
University of Oxford
Antoine D. Rolland
Institut de recherche en santé, environnement et travail
Raphael Scharfmann
Institut Cochin
Michèle Souyri
  • Fonction : Auteur
Hématopoïèse normale et pathologique : émergence, environnement et recherche translationnelle [Paris]
Erik Sundström
  • Fonction : Auteur
Karolinska Institute
Stéphane Zaffran
Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille
Matthias Zilbauer
  • Fonction : Auteur
University of Cambridge [UK]
Karolinska Institute

Résumé

The Human Developmental Cell Atlas (HDCA) initiative, which is part of the Human Cell Atlas, aims to create a comprehensive reference map of cells during development. This will be critical to understanding normal organogenesis, the effect of mutations, environmental factors and infectious agents on human development, congenital and childhood disorders, and the cellular basis of ageing, cancer and regenerative medicine. Here we outline the HDCA initiative and the challenges of mapping and modelling human development using state-of-the-art technologies to create a reference atlas across gestation. Similar to the Human Genome Project, the HDCA will integrate the output from a growing community of scientists who are mapping human development into a unified atlas. We describe the early milestones that have been achieved and the use of human stem-cell-derived cultures, organoids and animal models to inform the HDCA, especially for prenatal tissues that are hard to acquire. Finally, we provide a roadmap towards a complete atlas of human development.

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Soumis le : jeudi 10 octobre 2024-15:10:50

Dernière modification le : jeudi 31 octobre 2024-03:25:40

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Dates et versions

hal-03365045 , version 1 (10-10-2024)

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Citer

Muzlifah Haniffa, Deanne Taylor, Sten Linnarsson, Bruce Aronow, Gary Bader, et al.. A roadmap for the Human Developmental Cell Atlas. Nature, 2021, 597 (7875), pp.196-205. ⟨10.1038/s41586-021-03620-1⟩. ⟨hal-03365045⟩

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