Complex population structure of the Atlantic puffin revealed by whole genome analyses - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Communications Biology Année : 2021

Complex population structure of the Atlantic puffin revealed by whole genome analyses

Oliver Kersten
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Bastiaan Star
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Deborah Leigh
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Tycho Anker-Nilssen
  • Fonction : Auteur
Hallvard Strøm
  • Fonction : Auteur
Jóhannis Danielsen
  • Fonction : Auteur
Sébastien Descamps
Kjell Erikstad
  • Fonction : Auteur
Michelle Fitzsimmons
  • Fonction : Auteur
Jérôme Fort
Erpur Hansen
  • Fonction : Auteur
Mike Harris
  • Fonction : Auteur
Martin Irestedt
  • Fonction : Auteur
Oddmund Kleven
  • Fonction : Auteur
Mark Mallory
  • Fonction : Auteur
Kjetill Jakobsen
  • Fonction : Auteur
Sanne Boessenkool
  • Fonction : Auteur

Résumé

Abstract The factors underlying gene flow and genomic population structure in vagile seabirds are notoriously difficult to understand due to their complex ecology with diverse dispersal barriers and extensive periods at sea. Yet, such understanding is vital for conservation management of seabirds that are globally declining at alarming rates. Here, we elucidate the population structure of the Atlantic puffin ( Fratercula arctica ) by assembling its reference genome and analyzing genome-wide resequencing data of 72 individuals from 12 colonies. We identify four large, genetically distinct clusters, observe isolation-by-distance between colonies within these clusters, and obtain evidence for a secondary contact zone. These observations disagree with the current taxonomy, and show that a complex set of contemporary biotic factors impede gene flow over different spatial scales. Our results highlight the power of whole genome data to reveal unexpected population structure in vagile marine seabirds and its value for seabird taxonomy, evolution and conservation.
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Dates et versions

hal-03346894 , version 1 (22-11-2021)

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Citer

Oliver Kersten, Bastiaan Star, Deborah Leigh, Tycho Anker-Nilssen, Hallvard Strøm, et al.. Complex population structure of the Atlantic puffin revealed by whole genome analyses. Communications Biology, 2021, 4 (1), ⟨10.1038/s42003-021-02415-4⟩. ⟨hal-03346894⟩

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