Extension of the Visualization Tool MapMan to Allow Statistical Analysis of Arrays, Display of Coresponding Genes, and Comparison with Known Responses - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Plant Physiology Année : 2005

Extension of the Visualization Tool MapMan to Allow Statistical Analysis of Arrays, Display of Coresponding Genes, and Comparison with Known Responses

Björn Usadel
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Axel Nagel
  • Fonction : Auteur
Oliver Thimm
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Henning Redestig
  • Fonction : Auteur
Oliver Blaesing
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Natalia Palacios-Rojas
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Joachim Selbig
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Jan Hannemann
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Maria Conceição Piques
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Dirk Steinhauser
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Wolf-Rüdiger Scheible
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Yves Gibon
Rosa Morcuende
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Daniel Weicht
  • Fonction : Auteur
Svenja Meyer
  • Fonction : Auteur

Résumé

Abstract MapMan is a user-driven tool that displays large genomics datasets onto diagrams of metabolic pathways or other processes. Here, we present new developments, including improvements of the gene assignments and the user interface, a strategy to visualize multilayered datasets, the incorporation of statistics packages, and extensions of the software to incorporate more biological information including visualization of coresponding genes and horizontal searches for similar global responses across large numbers of arrays.

Dates et versions

hal-03321587 , version 1 (17-08-2021)

Identifiants

Citer

Björn Usadel, Axel Nagel, Oliver Thimm, Henning Redestig, Oliver Blaesing, et al.. Extension of the Visualization Tool MapMan to Allow Statistical Analysis of Arrays, Display of Coresponding Genes, and Comparison with Known Responses. Plant Physiology, 2005, 138 (3), pp.1195-1204. ⟨10.1104/pp.105.060459⟩. ⟨hal-03321587⟩
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