Cross-species genomics reveals oncogenic dependencies in ZFTA/C11orf95 fusion-positive supratentorial ependymomas
Cross-species genomics reveals oncogenic dependencies in ZFTA/C11orf95 fusion-positive supratentorial ependymomas.
Tuyu Zheng
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David Ghasemi
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Konstantin Okonechnikov
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Andrey Korshunov
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Martin Sill
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Kendra Maass
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Patricia Benites Goncalves da Silva
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Marina Ryzhova
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Johannes Gojo
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Damian Stichel
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Amir Arabzade
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Robert Kupp
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Julia Benzel
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Shinichiro Taya
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Toma Adachi
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Ryo Shiraishi
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Nicolas Gerber
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Dominik Sturm
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Jonas Ecker
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Philipp Sievers
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Florian Selt
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Rebecca Chapman
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Christine Haberler
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Dominique Figarella‑branger
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Guido Reifenberger
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Gudrun Fleischhack
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Stefan Rutkowski
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Andrew Donson
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Vijay Ramaswamy
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David Capper
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David Ellison
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Christel Herold-Mende
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Ulrich Schuller
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Sebastian Brandner
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Pablo Hernaiz Driever
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Johan Kros
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Matija Snuderl
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Till Milde
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Richard Grundy
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Mikio Hoshino
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Stephen Mack
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Richard Gilbertson
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David T.W. Jones
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Marcel Kool
,
Andreas von Deimling
,
Stefan Pfister
,
Felix Sahm
,
Daisuke Kawauchi
,
Kristian Pajtler
Tuyu Zheng
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David Ghasemi
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Konstantin Okonechnikov
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Andrey Korshunov
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Martin Sill
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Kendra Maass
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Patricia Benites Goncalves da Silva
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Marina Ryzhova
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Damian Stichel
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Amir Arabzade
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Robert Kupp
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Toma Adachi
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Ryo Shiraishi
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Nicolas Gerber
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Rebecca Chapman
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Dominique Figarella‑branger
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Guido Reifenberger
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Gudrun Fleischhack
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Stefan Rutkowski
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Andrew Donson
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Vijay Ramaswamy
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David Capper
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David Ellison
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Christel Herold-Mende
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Sebastian Brandner
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Pablo Hernaiz Driever
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Till Milde
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Richard Grundy
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Mikio Hoshino
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Stephen Mack
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Marcel Kool
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Andreas von Deimling
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Stefan Pfister
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Felix Sahm
- Fonction : Auteur
Daisuke Kawauchi
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Kristian Pajtler
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Résumé
Molecular groups of supratentorial ependymomas comprise tumors with ZFTA-RELA or YAP1-involving fusions and fusion-negative subependymoma. However, occasionally supratentorial ependymomas cannot be readily assigned to any of these groups due to lack of detection of a typical fusion and/or ambiguous DNA methylation-based classification. An unbiased approach with a cohort of unprecedented size revealed distinct methylation clusters composed of tumors with ependymal but also various other histological features containing alternative translocations that shared ZFTA as a partner gene. Somatic overexpression of ZFTA-associated fusion genes in the developing cerebral cortex is capable of inducing tumor formation in vivo, and cross-species comparative analyses identified GLI2 as a key downstream regulator of tumorigenesis in all tumors. Targeting GLI2 with arsenic trioxide caused extended survival of tumor-bearing animals, indicating a potential therapeutic vulnerability in ZFTA fusion-positive tumors.