Le phénotypage assisté par modèle : une méthode performante pour identifier des traits de sélection pour l’architecture racinaire
Abstract
Être capable de caractériser la diversité génétique du système racinaire est un enjeu réel
pour la sélection, et notamment pour proposer des variétés multi-performantes, adaptées aux
nouveaux agro-écosystèmes au sein desquels les interactions plante-sol jouent un rôle majeur, du fait
des multiples fonctions du système racinaire. Cependant les méthodes directes de phénotypage au
champ du système racinaire sont rarement compatibles avec la caractérisation d’un grand nombre
d’accessions. De ce fait, le système racinaire est souvent caractérisé à des stades précoces et dans des
conditions contrôlées, ne permettant pas toujours une bonne prédiction des phénotypes en conditions
agronomiques. Ici nous présentons une méthode complémentaire, le phénotypage assisté par modèle,
basée sur le phénotypage de variables “processus”, estimées à partir du modèle ARCHISIMPLE et
permettant d’accéder aux mécanismes contrôlant la mise en place de l’architecture racinaire. La mise
en oeuvre de cette approche novatrice pour la caractérisation des systèmes racinaires est ensuite
illustrée à travers l’analyse de la diversité génétique de l’architecture racinaire du colza. Nous
montrons comment ces paramètres du modèle constituent des traits de sélection efficaces,
permettant de proposer des idéotypes adaptés à des systèmes de culture à faibles niveaux d’intrants
azotés, qui optimisent l’exploration du sol et l’absorption de l’azote.