Evaluation de l’efficacité de trois méthodes d’extraction d’ADN de la biomasse microbienne totale du compost
Résumé
DNA extraction from compost make easy the detection of microorganisms non discernable by classic and usual methods. In fact, we have examined three different methods and try to perform them. So, we found an important level of cell lysis by the freezing thawing cycles, we found also the important elimination of impurities by CTAB-PVPP, it is shown by a clarification of the samples. The mix PEG-NaCl made a good purification of the DNA.
L’extraction des acides nucléiques à partir du compost permet de détecter des microorganismes non détectables par les méthodes classiques. En effet, nous avons essayé trois méthodes différentes et nous avons remarqué l’importance d’une bonne lyse cellulaire pour la libération de l’ADN (8 cycles de congélation-décongélation). L’utilisation du mélange CTABPVPP a été remarquable puisque ce dernier a permis d’éliminer des impuretés, ce qui s’est traduit par un éclaircissement des échantillons bruns originels. La méthode de purification la plus efficace est celle qui utilise le mélange PEG-NaCl
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