Attractifs pour les sociétés anciennes, qui n’ont pas hésité à s’installer sur des espaces a priori hostilescar situés dans des zones de débordement, les cours d’eau ont été aménagés et contraints au cours despériodes historiques. Ils ont fossilisé de nombreux témoins d'activités humaines et ont enregistré, dansleurs sédiments, les manifestations des changements climatiques et environnementaux qui marquentencore les formes actuelles du paysage et dont la compréhension est devenue un des enjeux de nossociétés.Ce programme pluri-annuel s’était fixé pour principal objectif la collecte et l’analyse de donnéessusceptibles de faire progresser la connaissance du milieu fluvial sur la longue durée (de l’âge duBronze au XIXe siècle) : anthropisation des lits mineurs et majeurs, aménagements liés à l’eau, impactdes occupations et de l’exploitation des ressources sur le milieu fluvial, quantification des impactsclimatiques sur l’évolution des hydrosystèmes. Cette recherche de nouvelles données intègre plusieursdisciplines et méthodes : prospections par relevés bathymétriques haute résolution, sondages et fouillessubaquatiques, prospections terrestres et subaquatiques, analyse de documents anciens (textes et plans),études sédimentaires (carottages) dans les plaines alluviales, analyse de relevés Lidar et de clichéssatellite. Elle bénéficie de compétences mises en oeuvre au cours de précédents programmes réalisés surdifférents cours d’eau de Bourgogne-Franche-Comté (Saône-Doubs, CPER, BQR Pres, Loire amont etmoyenne–Feder Plan Loire grandeur Nature), et d’autres régions (rivière Oise, fleuves Charente,Hérault, Seine).Le regroupement dans un PCR est à la hauteur de la richesse des découvertes et des compétencesdisponibles ; il permet de développer un programme plus ambitieux sur les évolutions de plusieurs coursd’eau, et sur un patrimoine qui reste très fragilisé et menacé par différents aménagements.