Plant recommendation using the environment and biotic associations - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Communication Dans Un Congrès Année : 2019

Plant recommendation using the environment and biotic associations

Recommendation de plantes en utilisant les conditions environnementales et les associations biotiques

Mickael Hedde
Wilfried Thuiller

Résumé

Automatically predicting species make-up in geographic locations is of great importance in the context of the current conversation about biodiversity. Inspired by the ecological concepts of Grinnellian and Eltonian niches, we investigate two neural network architectures that aim to that aim to exploit the respective features of these two types of niches in order to tackle the plant recommendation task. The first proposal uses environmental rasters and leverages advanced feature extraction techniques based on distributed representations and convolutional neu-ral networks. The second proposal relies on neighboring co-occurrences of plants and organisms from an expert-curated list of taxa. We find that the former solution outperforms the latter in prediction accuracy, yet the second solution provides interesting and more interpretable indicators. Both approaches yield promising results on the GeoLifeCLEF 2019 challenge.
La prédiction automatique de la composition des espèces dans des lieux géographiques est d'une grande importance dans le contexte de la conversation actuelle sur la biodiversité. Inspirés par les concepts écologiques des niches grinelloises et eltoniennes, nous étudions deux architectures de réseaux neuronaux qui visent à exploiter les caractéristiques respectives de ces deux types de niches afin d'aborder la tâche de recommandation des plantes. La première proposition utilise des trames environnementales et exploite des techniques avancées d'extraction de caractéristiques basées sur des représentations distribuées et des réseaux neuro-naux convolutifs. La seconde proposition s'appuie sur des cooccurrences voisines de plantes et d'organismes provenant d'une liste de taxons établie par des experts. Nous constatons que la première solution surpasse la seconde en termes de précision des prédictions, mais la seconde solution fournit des indicateurs intéressants et plus faciles à interpréter. Les deux approches donnent des résultats prometteurs dans le cadre du défi GeoLifeCLEF 2019.
Fichier principal
Vignette du fichier
paper_72.pdf (884 Ko) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)
Loading...

Dates et versions

hal-02970576 , version 1 (18-10-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-02970576 , version 1

Citer

Sara Si-Moussi, Mickael Hedde, Wilfried Thuiller. Plant recommendation using the environment and biotic associations. Working Notes of CLEF 2019 - Conference and Labs of the Evaluation Forum, Sep 2019, Lugano, Switzerland. ⟨hal-02970576⟩

Collections

INRAE
87 Consultations
43 Téléchargements

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More