Inborn errors of type I IFN immunity in patients with life-threatening COVID-19
2 Imagine - U1163 - Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
3 Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
4 HIPI (UMR_S_976 / U976) - Immunologie humaine, physiopathologie & immunothérapie
5 GenCellDis (U944 / UMR7212) - Génomes, biologie cellulaire et thérapeutiques
6 CIMI - Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses
7 Immunologie Translationnelle - Translational Immunology lab
8 PASS - Unité Mixte de Service Production et Analyse de données en Sciences de la vie et en Santé
9 PASS-CYPS - Cytométrie Pitié-Salpêtrière
10 C2VN - Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research
11 IAME (UMR_S_1137 / U1137) - Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution
12 CIC - CHU Bichat
13 CIC - Centre d'Investigation Clinique [Rennes]
14 CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé
15 MYRIAD - Modeling & analysis for medical imaging and Diagnosis
16 CNRS-UMR3569 - Virologie - Virology
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Résumé
Clinical outcome upon infection with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) ranges from silent infection to lethal coronavirus disease 2019 (COVID-19). We have found an enrichment in rare variants predicted to be loss-of-function (LOF) at the 13 human loci known to govern Toll-like receptor 3 (TLR3)– and interferon regulatory factor 7 (IRF7)–dependent type I interferon (IFN) immunity to influenza virus in 659 patients with life-threatening COVID-19 pneumonia relative to 534 subjects with asymptomatic or benign infection. By testing these and other rare variants at these 13 loci, we experimentally defined LOF variants underlying autosomal-recessive or autosomal-dominant deficiencies in 23 patients (3.5%) 17 to 77 years of age. We show that human fibroblasts with mutations affecting this circuit are vulnerable to SARS-CoV-2. Inborn errors of TLR3- and IRF7-dependent type I IFN immunity can underlie life-threatening COVID-19 pneumonia in patients with no prior severe infection.
| Origine | Publication financée par une institution |
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