UnityMol prototype for FAIR sharing of molecular- visualization experiences: from pictures in the cloud to collaborative virtual reality exploration in immersive 3D environments - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-...] Année : 2021

UnityMol prototype for FAIR sharing of molecular- visualization experiences: from pictures in the cloud to collaborative virtual reality exploration in immersive 3D environments

Résumé

Synopsis Visualization renders structural molecular data accessible to a broad audience. We describe an approach to share molecular visualization experiences based on FAIR principles. Our workflow is exemplified with recent Covid-19 related data. Abstract Motivated by the current Covid-19 pandemic that has spurred a substantial flow of structural data we describe how molecular visualization experiences can be used to make these datasets accessible to a broad audience. Using a variety of technology vectors related to the cloud, 3D-and virtual reality gear, we examine how to share curated visualizations of structural biology, modeling and/or bioinformatics datasets for interactive and collaborative exploration. We discuss F.A.I.R. as overarching principle for sharing such visualizations. We provide four initial example scenes related to recent Covid-19 structural data together with a ready-to-use (and share) implementation in the UnityMol software.
Motivé par la pandémie actuelle de Covid-19 qui a stimulé un flux substantiel de données structurelles, nous décrivons comment les expériences de visualisation moléculaire peuvent être utilisées pour rendre ces ensembles de données accessibles à un large public. En utilisant une variété de vecteurs technologiques liés au cloud, à l'équipement de réalité 3D et virtuelle, nous examinons comment partager des visualisations organisées de données de biologie structurale, de modélisation et / ou de bioinformatique pour l'exploration interactive et collaborative. Nous discutons de F. UNE. JE. R. comme principe primordial pour partager de telles visualisations. Nous fournissons quatre exemples initiaux de scènes liées aux données structurelles récentes de Covid-19 ainsi qu'une implémentation prête à l'emploi (et à partager) dans le logiciel UnityMol. Synopsis Visualization rend les données moléculaires structurelles accessibles à un large public. Nous décrivons une approche pour partager des expériences de visualisation moléculaire basées sur les principes FAIR. Notre flux de travail est illustré par les récentes données liées à Covid-19. Résumé Motivé par la pandémie actuelle de Covid-19 qui a stimulé un flux substantiel de données structurelles, nous décrivons comment les expériences de visualisation moléculaire peuvent être utilisées pour rendre ces ensembles de données accessibles à un large public. En utilisant une variété de vecteurs technologiques liés au cloud, à l'équipement de réalité 3D et virtuelle, nous examinons comment partager des visualisations organisées de données de biologie structurale, de modélisation et / ou de bioinformatique pour l'exploration interactive et collaborative. Nous discutons de F. UNE. JE. R. comme principe primordial pour partager de telles visualisations. Nous fournissons quatre exemples initiaux de scènes liées aux données structurelles récentes de Covid-19 ainsi qu'une implémentation prête à l'emploi (et à partager) dans le logiciel UnityMol.
Fichier principal
Vignette du fichier
qr5004.pdf (1.58 Mo) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte

Dates et versions

hal-02944943 , version 1 (21-09-2020)
hal-02944943 , version 2 (24-11-2021)

Identifiants

Citer

Xavier Martinez, Marc Baaden. UnityMol prototype for FAIR sharing of molecular- visualization experiences: from pictures in the cloud to collaborative virtual reality exploration in immersive 3D environments. Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2021, 77 (6), pp.746-754. ⟨10.1107/S2059798321002941⟩. ⟨hal-02944943v2⟩
138 Consultations
102 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More