Utilisation des premières données pour estimer le taux de mortalité par infection du COVID-19 en France - Archive ouverte HAL Access content directly
Translation Biology Year : 2020

Utilisation des premières données pour estimer le taux de mortalité par infection du COVID-19 en France

Etienne E. Klein
Julien Papaïx
  • Function : Author
Antoine Sar
  • Function : Author
Samuel Soubeyrand

Abstract

Le nombre de tests de dépistage réalisés en France et la méthodologie utilisée pour cibler les patients testés ne permettent pas de calculer directement le nombre réel de cas et le taux de mortalité infectieuse (IFR). L'objectif principal de ce travail est d'estimer le nombre réel de personnes infectées par le COVID-19 et de déduire l'IFR lors de la fenêtre d'observation en France. Nous développons une approche «mécaniste-statistique» couplant un modèle épidémiologique SIR décrivant la dynamique épidémiologique non observée, un modèle probabiliste décrivant le processus d'acquisition des données et une méthode d'inférence statistique. Le nombre réel de cas infectés en France est probablement supérieur aux observations: on retrouve ici un facteur × 8 (95% -CI: 5–12) qui conduit à un IFR en France de 0,5% (95% -CI: 0,3– 0.8) sur la base des données de comptage des décès à l'hôpital. En ajustant le nombre de décès dans les maisons de retraite, nous obtenons un IFR de 0,8% (IC 95%: 0,45-1,25). Cet IFR est conforme aux résultats précédents en Chine (0,66%) et au Royaume-Uni (0,9%) et inférieur à la valeur précédemment calculée sur les données du navire Diamond Princess (1,3%).
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Dates and versions

hal-02940338 , version 1 (16-09-2020)

Identifiers

  • HAL Id : hal-02940338 , version 1

Cite

Lionel Roques, Etienne E. Klein, Julien Papaïx, Antoine Sar, Samuel Soubeyrand. Utilisation des premières données pour estimer le taux de mortalité par infection du COVID-19 en France. 2020, pp.9(5), 97. ⟨hal-02940338⟩

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