DIAGSOL : Développement d’un outil microbien pour évaluer l’exposition des sols agricoles aux herbicides β-tricétones
Résumé
En 2011, en France, plus de 2 millions d’hectares de champs de maïs ont été traités avec des herbicides β-tricétones. Qualifiés de « respectueux de l’environnement » en raison d’une efficacité à faible dose, de récentes études ont démontré un effet transitoire des β-tricétones sur la diversité bactérienne des sols (Romdhane et al., 2016). L’utilisation récurrente des β-tricétones pourrait, à terme, perturber la diversité bactérienne et les fonctions écosystémiques des sols qu’elle soutient. Il est essentiel d’évaluer l’exposition des microorganismes des sols aux β-tricétones. L’enzyme 4-hydroxyphénylpyruvate dioxygénase (4-HPPD), cible de ces herbicides chez les plantes adventices, est retrouvée chez de nombreuses bactéries. De ce fait, le gène hppd pourrait constituer un biomarqueur d’exposition. Afin d’explorer cette perspective, des couples d’amorces spécifiques ont été dessinés à l’aide des 1200 séquences hppd disponibles dans GenBank. Leur spécificité a été validée par le clonage et le séquençage d’amplicons générés à partir d’ADN bactérien extrait d’un sol. Des essais de qPCR visant à quantifier l’abondance des séquences hppd dans les sols ont été développés. Une expérience en microcosmes de sol exposés ou non à différentes doses de sulcotrione est en cours. La dissipation de la sulcotrione dans le temps sera calculée et l’impact écotoxicologique de cet herbicide sur les bactéries sera estimé en quantifiant l’évolution de l’abondance et de la diversité des séquences hppd. Nous prévoyons de réitérer cette approche en microcosmes à partir du DECANO®, produit formulé de la sulcotrione. Ces résultats seront présentés à la session EcotoxicoMic.