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Article Dans Une Revue Genome Année : 2019

DNA barcodes reveal deeply neglected diversity and numerous invasions of micromoths in Madagascar

Résumé

Madagascar is a prime evolutionary hotspot globally, but its unique biodiversity is under threat, essentially from anthropogenic disturbance. There is a race against time to describe and protect the Madagascan endangered biota. Here we present a first molecular characterization of the micromoth fauna of Madagascar. We collected 1572 micromoths mainly using light traps in both natural and anthropogenically disturbed habitats in 24 localities across eastern and northwest Madagascar. We also collected 1384 specimens using a Malaise trap in a primary rain forest at Andasibe, eastern Madagascar. In total, we DNA barcoded 2956 specimens belonging to 1537 Barcode Index Numbers (BINs), 88.4% of which are new to BOLD. Only 1.7% of new BINs were assigned to species. Of 47 different families found, Dryadaulidae, Bucculatricidae, Bedelliidae, Batrachedridae, and Blastobasidae are newly reported for Madagascar and the recently recognized Tonzidae is confirmed. For test faunas of Canada and Australia, 98.9%-99.4% of Macroheterocera BINs exhibited the molecular synapomorphy of a phenylalanine in the 177th complete DNA barcode codon. Non-macroheteroceran BINs could thus be sifted out efficiently in the Malaise sample. The Madagascar micromoth fauna shows highest affinity with the Afrotropics (146 BINs also occur in the African continent). We found 22 recognised pests or invasive species, mostly occurring in disturbed habitats. Malaise trap samples show high temporal turnover and alpha diversity with as many as 507 BINs collected; of these, astonishingly, 499 (98.4%) were novel to BOLD and 292 (57.6%) were singletons. Our results provide a baseline for future surveys across the island.
Madagascar est un haut lieu de l'évolution au niveau mondial, mais sa biodiversité unique est menacée, essentielle-ment en raison de perturbations anthropogéniques. Une course contre la montre est engagée pour décrire et protéger le biote malgache menacé. Dans ce travail, les auteurs présentent une première caractérisation moléculaire des « microlépidoptères » de Madagascar. Les auteurs ont récolté 1572 spécimens en utilisant principalement des pièges lumineux (dans des milieux tantôt naturels, tantôt perturbés par l'Homme) au sein de 24 localités dispersées à travers l'est et le nord-ouest de Madagascar. Ils ont aussi collecté 1384 spécimens à l'aide d'un piège Malaise dans une forêt primaire humide à Andasibe. Au total, les codes-barres ADN ont été séquencés pour 2956 spécimens correspondant à 1537 BIN, dont 88,4 % sont inédits dans BOLD. Seuls 1,7 % des nouveaux BIN ont été assignés à une espèce connue. Parmi les 47 familles trouvées, les Dryadaulidae, Bucculatricidae, Bedellii-dae, Batrachedridae et Blastobasidae sont signalés pour la première fois de Madagascar. La faune étudiée présente la plus grande affinité avec l'écozone afrotropicale (dans laquelle se retrouvent 146 BIN). Les auteurs ont trouvé 22 ravageurs connus ou espèces envahissantes, principalement dans les habitats perturbés. Les spécimens provenant des pièges Malaise diffèrent au fil du temps et présentent une grande diversité alpha, leur total pouvant atteindre 507 BIN. Parmi ceux-ci, étonnamment, 499 (98,4 %) sont inédits dans BOLD et 292 (57,6 %) ont été vus une seule fois. Ces résultats fournissent un référentiel pour de futures études dans d'autres régions de l'île.
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2018 (Nov.)_Lopez-Vaamonde et al (early view)_DNA barcodes reveal deeply neglected diversity (Madagascar micros)_Genome.pdf (1.22 Mo) Télécharger le fichier
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Dates et versions

hal-02613924 , version 1 (20-05-2020)

Identifiants

Citer

Carlos Lopez-Vaamonde, Lucas Sire, Bruno Rasmussen, Rodolphe Rougerie, Christian Wieser, et al.. DNA barcodes reveal deeply neglected diversity and numerous invasions of micromoths in Madagascar. Genome, 2019, 62 (3), pp.108-121. ⟨10.1139/gen-2018-0065⟩. ⟨hal-02613924⟩
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