Présenter les défis scientifiques et les enjeux sociétaux des aires marines protégées a permis de mettre en évidence certaines problématiques inhérentes à la multiplication sans précédent de ces aires marines protégées. L’ambition de cet ouvrage était d’exposer, de la manière la plus objective possible, les avantages,inconvénients et éventuels risques de ce développement d’espaces naturels protégés en mer.À l’instar des aires protégées terrestres, il est toujours tentant de chercher à comparer les zones protégées à celles qui ne le sont pas et de mettre en opposition les zones marines classées avec celles ne bénéficiant d’aucune protection. L’une est-elle systématiquement mieux protégée que l’autre ? Les première sont-elles vocation à servir de laboratoire expérimental pour les secondes (AUBERTIN et RODARY, 2008) ? En tout état de cause, la protection des socio-écosystèmes nécessite à la fois des recherches issues des sciences naturelles et d’analyses en termes de gouvernance. Les travaux présentés dans cet ouvrage ont permis de démontrer que des controverses et difficultés d’application existent, mais qu’elles ne doivent pas diminuer l’importance des aires marines protégées, notamment pour la résilience des écosystèmes face aux pressions anthropiques et au changement climatique. Car, au-delà de l’écosystème concerné par la réglementation de l’AMP, la mise en place d’aires marines protégées a de nombreux autres effets qu’il importe de souligner.