Le diagnostic est un élément central d’une dé-marche clinique. Ce texte dessine les contours d’un diagnostic stratégique, et ce que modifie le fait d’in-tégrer les enjeux environnementaux dans les sys-tèmes agricoles. L’activité de diagnostic y est analy-sée à l’aide des cadres de l’ergonomie cognitive et de l’agronomie. Nous nous intéressons à ce qu’implique le diagnostic orienté vers l’action que l’agronome, qu’il soit chercheur, conseiller, agriculteur, pratique quand il envisage de piloter un système biotechnique dynamique et ouvert comme le système de culture dans son champ. L’accent est mis sur l’importance du couplage entre le système et le ou les acteurs qui le pilote(nt), qui agissent en fonction d’une visée. Pour faire usage de l’outil de diagnostic, ceux-ci mobilisent leurs propres représentations du système et des indices orientés par ou vers l’action afin d’analyser la situation et son évolution éventuelle. Deux exemples illustrent des dé-marches de diagnostic que nous qualifions ici de stratégique car il vise à mener une enquête pour concevoir et piloter des systèmes intégrant des objectifs de performance environnementale. Le premier exemple permet de montrer comment le diagnostic, lors de tours de plaine entre conseillers et agriculteurs, se transforme dès lors qu’il s’agit d’intégrer des enjeux environnementaux et de repenser l’ensemble du système de culture. Le tour de plaine devient l’occasion de discuter ce que l’observation révèle des dynamiques d’évolution sur le long terme, et des critères d’évaluation d’un « beau champ ». Le second exemple repose sur les usages qui sont faits de l’outil Syst’N. L’analyse de ces usages montre l’importance que prend, dans un diagnostic visant à évaluer les pertes azotées, la possibilité de se représenter les flux d’azote pour comprendre l’origine des pertes dans la situation donnée ou encore pour identifier et tester virtuelle-ment des pistes d’action. La discussion finale ouvre la ré-flexion sur l’enjeu de mieux appréhender la diversité des en-quêtes à mener « sur le champ » dans un contexte de transition agroécologique et sur la nécessité de revoir les dispositifs organisationnels pour développer une activité de dia-gnostic stratégique dans ce contexte.