Tracking Five Millennia of Horse Management with Extensive Ancient Genome Time Series - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Cell Année : 2019

Tracking Five Millennia of Horse Management with Extensive Ancient Genome Time Series

Antoine Fages (1, 2) , Kristian Hanghøj (1, 2) , Naveed Khan (3) , Charleen Gaunitz (2) , Andaine Seguin-Orlando (4, 1) , Michela Leonardi (2, 5) , Christian Mccrory Constantz (2) , Cristina Gamba (6, 2) , Khaled A.S. Al-Rasheid (7) , Silvia Albizuri (8, 9) , Ahmed H Alfarhan (7) , Morten Allentoft (2) , Saleh Alquraishi (7) , David Anthony (10) , Nurbol Baimukhanov (11) , James Barrett (12) , Jamsranjav Bayarsaikhan (13) , Norbert Benecke (14) , Eloísa Bernáldez-Sánchez , Luis Berrocal-Rangel , Fereidoun Biglari (15) , Sanne Boessenkool , Bazartseren Boldgiv , Gottfried Brem (16) , Dorcas Brown , Joachim Burger , Eric Crubezy (1) , Linas Daugnora , Hossein Davoudi (17) , Peter de Barros Damgaard , María de Los Ángeles de Chorro y de Villa-Ceballos , Sabine Deschler-Erb , Cleia Detry (18) , Nadine Dill , Maria Do Mar Oom , Anna Dohr , Sturla Ellingvåg , Diimaajav Erdenebaatar , Homa Fathi , Sabine Felkel , Carlos Fernandez-Rodriguez (19) , Esteban García-Viñas , Mietje Germonpré (20) , José Granado , Jón Hallsson , Helmut Hemmer , Michael Hofreiter (21) , Aleksei Kasparov , Mutalib Khasanov (22) , Roya Khazaeli , Pavel Kosintsev , Kristian Kristiansen , Tabaldiev Kubatbek , Lukas Kuderna , Pavel Kuznetsov , Haeedeh Laleh , Jennifer Leonard , Johanna Lhuillier (23) , Corina Liesau von Lettow-Vorbeck , Andrey Logvin , Lembi Lõugas , Arne Ludwig (24) , Cristina Luis , Ana Margarida Arruda (18) , Tomas Marques-Bonet (25) , Raquel Matoso Silva , Victor Merz , Enkhbayar Mijiddorj , Bryan Miller , Oleg Monchalov , Fatemeh Mohaseb , Arturo Morales , Ariadna Nieto-Espinet , Heidi Nistelberger , Vedat Onar , Albína Pálsdóttir , Vladimir Pitulko , Konstantin Pitskhelauri , Mélanie Pruvost (15) , Petra Rajic Sikanjic , Anita Rapan Papeša , Natalia Roslyakova , Alireza Sardari , Eberhard Sauer , Renate Schafberg , Amelie Scheu , Jörg Schibler (26) , Angela Schlumbaum (26) , Nathalie Serrand (27, 28) , Aitor Serres-Armero , Beth Shapiro , Shiva Sheikhi Seno , Irina Shevnina , Sonia Shidrang (29) , John R. Southon (30) , Bastiaan Star , Naomi Sykes , Kamal Taheri , William Taylor , Wolf-Rüdiger Teegen , Tajana Trbojević Vukičević , Simon Trixl , Dashzeveg Tumen , Sainbileg Undrakhbold , Emma Usmanova , Ali Vahdati , Silvia Valenzuela-Lamas (31) , Catarina Viegas (32) , Barbara Wallner , Jaco Weinstock , Victor Zaibert , Benoît Clavel (33) , Sébastien Lepetz (28) , Marjan Mashkour (28) , Agnar Helgason , Kari Stefansson (34) , Eric Barrey (35) , Eske Willerslev (6) , Alan Outram , Pablo Librado (6) , Ludovic Orlando (6)
1 AMIS - Anthropologie Moléculaire et Imagerie de Synthèse
2 UCPH - University of Copenhagen = Københavns Universitet
3 Abdul Wali Khan University
4 UT3 - Université Toulouse III - Paul Sabatier
5 CAM - University of Cambridge [UK]
6 Section for GeoGenetics
7 KSU - King Saud University [Riyadh]
8 SERP
9 UB - Universitat de Barcelona
10 Anthropology Department - Hartwick College
11 Shejire DNA project
12 McDonald Institute for Archaeological Research
13 National Center of Mental Health of Mongolia
14 DAI - Deutsches Archäologisches Institut
15 PACEA - De la Préhistoire à l'Actuel : Culture, Environnement et Anthropologie
16 Institute of Animal Breeding and Genetics, Department for Biomedical Sciences
17 Tarbiat Modares University [Tehran]
18 UNIARQ
19 Universidad de León [León]
20 Department of Palaeontology
21 Department of Evolutianory Genetics
22 Institut d'Archéologie de l'Académie des Sciences de l'Ouzbékistan [Tachkent, Ouzbékistan] = Institute of Archaeology of the Academy of Sciences of the Republic of Uzbekistan [Tashkent, Uzbekistan]
23 Archéorient - ARCHEORIENT - Environnements et sociétés de l'Orient ancien
24 Department of Evolutianory Genetics
25 ICREA - Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats = Catalan Institution for Research and Advanced Studies
26 Unibas - Université de Bâle = University of Basel = Basel Universität
27 Inrap - Institut national de recherches archéologiques préventives
28 AASPE - Archéozoologie, archéobotanique : sociétés, pratiques et environnements
29 Center for Palaeolithic Research
30 ESS - Department of Earth System Science [Irvine]
31 IMF - Institución Milá y Fontanals de investigación en Humanidades
32 NOVA - Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon
33 MNHN - Muséum national d'Histoire naturelle
34 deCODE Genetics
35 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative
Eloísa Bernáldez-Sánchez
  • Fonction : Auteur
Luis Berrocal-Rangel
  • Fonction : Auteur
Sanne Boessenkool
  • Fonction : Auteur
Bazartseren Boldgiv
Dorcas Brown
  • Fonction : Auteur
Joachim Burger
  • Fonction : Auteur
Linas Daugnora
  • Fonction : Auteur
Hossein Davoudi
Peter de Barros Damgaard
  • Fonction : Auteur
Sabine Deschler-Erb
  • Fonction : Auteur
Cleia Detry
  • Fonction : Auteur
Nadine Dill
  • Fonction : Auteur
Maria Do Mar Oom
  • Fonction : Auteur
Anna Dohr
  • Fonction : Auteur
Sturla Ellingvåg
  • Fonction : Auteur
Diimaajav Erdenebaatar
  • Fonction : Auteur
Homa Fathi
Sabine Felkel
  • Fonction : Auteur
Esteban García-Viñas
  • Fonction : Auteur
Mietje Germonpré
José Granado
  • Fonction : Auteur
Jón Hallsson
  • Fonction : Auteur
Helmut Hemmer
  • Fonction : Auteur
Aleksei Kasparov
  • Fonction : Auteur
Roya Khazaeli
  • Fonction : Auteur
Pavel Kosintsev
  • Fonction : Auteur
Kristian Kristiansen
  • Fonction : Auteur
Tabaldiev Kubatbek
  • Fonction : Auteur
Lukas Kuderna
  • Fonction : Auteur
Pavel Kuznetsov
  • Fonction : Auteur
Haeedeh Laleh
  • Fonction : Auteur
Jennifer Leonard
  • Fonction : Auteur
Andrey Logvin
  • Fonction : Auteur
Lembi Lõugas
  • Fonction : Auteur
Arne Ludwig
Cristina Luis
  • Fonction : Auteur
Ana Margarida Arruda
  • Fonction : Auteur
Raquel Matoso Silva
  • Fonction : Auteur
Victor Merz
  • Fonction : Auteur
Enkhbayar Mijiddorj
  • Fonction : Auteur
Bryan Miller
  • Fonction : Auteur
Oleg Monchalov
  • Fonction : Auteur
Fatemeh Mohaseb
Arturo Morales
  • Fonction : Auteur
Ariadna Nieto-Espinet
  • Fonction : Auteur
Heidi Nistelberger
  • Fonction : Auteur
Vedat Onar
  • Fonction : Auteur
Albína Pálsdóttir
  • Fonction : Auteur
Vladimir Pitulko
Konstantin Pitskhelauri
  • Fonction : Auteur
Petra Rajic Sikanjic
  • Fonction : Auteur
Anita Rapan Papeša
  • Fonction : Auteur
Natalia Roslyakova
Alireza Sardari
  • Fonction : Auteur
Eberhard Sauer
  • Fonction : Auteur
Renate Schafberg
  • Fonction : Auteur
Amelie Scheu
  • Fonction : Auteur
Aitor Serres-Armero
  • Fonction : Auteur
Beth Shapiro
Shiva Sheikhi Seno
  • Fonction : Auteur
Irina Shevnina
  • Fonction : Auteur
Bastiaan Star
  • Fonction : Auteur
Naomi Sykes
  • Fonction : Auteur
Kamal Taheri
  • Fonction : Auteur
William Taylor
Wolf-Rüdiger Teegen
  • Fonction : Auteur
Tajana Trbojević Vukičević
  • Fonction : Auteur
Simon Trixl
  • Fonction : Auteur
Dashzeveg Tumen
  • Fonction : Auteur
Sainbileg Undrakhbold
  • Fonction : Auteur
Emma Usmanova
  • Fonction : Auteur
Ali Vahdati
  • Fonction : Auteur
Barbara Wallner
Jaco Weinstock
  • Fonction : Auteur
Victor Zaibert
  • Fonction : Auteur
Benoît Clavel
Agnar Helgason
  • Fonction : Auteur
Kari Stefansson
  • Fonction : Auteur
Eric Barrey
Alan Outram
Ludovic Orlando

Résumé

Horse domestication revolutionized warfare and accelerated travel, trade, and the geographic expansion of languages. Here, we present the largest DNA time series for a non-human organism to date, including genome-scale data from 149 ancient animals and 129 ancient genomes (≥1-fold coverage), 87 of which are new. This extensive dataset allows us to assess the modern legacy of past equestrian civilizations. We find that two extinct horse lineages existed during early domestication, one at the far western (Iberia) and the other at the far eastern range (Siberia) of Eurasia. None of these contributed significantly to modern diversity. We show that the influence of Persian-related horse lineages increased following the Islamic conquests in Europe and Asia. Multiple alleles associated with elite-racing, including at the MSTN “speed gene,” only rose in popularity within the last millennium. Finally, the development of modern breeding impacted genetic diversity more dramatically than the previous millennia of human management.
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hal-02166928 , version 1 (27-06-2019)

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Citer

Antoine Fages, Kristian Hanghøj, Naveed Khan, Charleen Gaunitz, Andaine Seguin-Orlando, et al.. Tracking Five Millennia of Horse Management with Extensive Ancient Genome Time Series. Cell, 2019, 177 (6), pp.1419-1435.e31. ⟨10.1016/j.cell.2019.03.049⟩. ⟨hal-02166928⟩
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