An Aboriginal Australian Genome Reveals Separate Human Dispersals into Asia
Xiaosen Xiao
,
Yong Wang
(1)
,
Kirk E. Lohmueller
(2)
,
Rasmus Rasmussen
,
Anders Albrechtsen
(3)
,
Line Li
,
Stinus Li
,
Mait Metspalu
(4)
,
Thibaut Jombart
(5)
,
Toomas Kivisild
(6)
,
Weiwei Zhai
,
Anders Eriksson
(7)
,
Andrea Manica
,
Ludovic Orlando
(8)
,
Francisco de La Vega
,
Silvana Tridico
,
Ene Metspalu
(4)
,
Kasper Nielsen
,
María Ávila-Arcos
,
J. Víctor Moreno-Mayar
,
Craig Muller
,
Joe Dortch
,
Thomas Gilbert
,
Ole Lund
(9)
,
Agata Wesolowska
,
Monika Karmin
,
Lucy Anne Weinert
(10)
,
Biao Wang
,
Jun Li
,
Shuaishuai Tai
,
Fei Xiao
(11)
,
Tsunehiko Hanihara
,
George van Driem
,
Aashish Jha
,
François-Xavier Ricaut
(12)
,
Peter de Knijff
(13)
,
Andrea Migliano
,
Irene Gallego Romero
,
Karsten Kristiansen
(14)
,
David Lambert
,
Søren Brunak
(15)
,
Peter Forster
,
Bernd Brinkmann
,
Olaf Nehlich
,
Michael Bunce
,
Richard Richards
,
Ramneek Gupta
,
Carlos D. Bustamante
(2)
,
Anders Krogh
,
Robert Foley
,
Marta Lahr
(6)
,
François Balloux
(16)
,
Richard Villems
(17)
,
Rasmus Nielsen
(18)
,
Jun Wang
(19)
,
Eske Willerslev
(8)
,
M. Rasmussen
,
X. Guo
(20)
,
S. Rasmussen
,
L. Skotte
,
S. Lindgreen
,
M. de La Vega
,
M. Avila-Arcos
,
M. Gilbert
,
A. Weinert
,
X. Ricaut
,
M. Lambert
(21)
,
M. Richards
,
A. Foley
,
Thomas Sicheritz-Ponten
(9)
1
NJUST -
Nanjing University of Science and Technology
2 Department of Biological Statistics and Computational Biology
3 Section of Biostatistics [Copenhagen]
4 University of Tartu
5 MRC - Medical Research Council, Centre for Outbreak Analysis and Modelling
6 Leverhulme Centre for Human Evolutionary Studies University of Cambridge
7 IRF - Swedish Institute of Space Physics [Uppsala / Kiruna]
8 Section for GeoGenetics
9 Center for Biological Sequence Analysis
10 CAM - University of Cambridge [UK]
11 Interaction virus-hôte et maladies du foie
12 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
13 Center for Human and Clinical Genetics
14 Department of Biochemistry and Molecular Biology
15 DTU - Danmarks Tekniske Universitet = Technical University of Denmark
16 Edin. - University of Edinburgh
17 UAABC - Anthropologie Bio-Culturelle
18 Dept Integrat Biol
19 CCCME - Chinese Academy of Agricultural Mechanization Sciences
20 3SR - Laboratoire sols, solides, structures - risques [Grenoble]
21 Service de Médecine interne A et polyclinique médicale [CHU Limoges]
2 Department of Biological Statistics and Computational Biology
3 Section of Biostatistics [Copenhagen]
4 University of Tartu
5 MRC - Medical Research Council, Centre for Outbreak Analysis and Modelling
6 Leverhulme Centre for Human Evolutionary Studies University of Cambridge
7 IRF - Swedish Institute of Space Physics [Uppsala / Kiruna]
8 Section for GeoGenetics
9 Center for Biological Sequence Analysis
10 CAM - University of Cambridge [UK]
11 Interaction virus-hôte et maladies du foie
12 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
13 Center for Human and Clinical Genetics
14 Department of Biochemistry and Molecular Biology
15 DTU - Danmarks Tekniske Universitet = Technical University of Denmark
16 Edin. - University of Edinburgh
17 UAABC - Anthropologie Bio-Culturelle
18 Dept Integrat Biol
19 CCCME - Chinese Academy of Agricultural Mechanization Sciences
20 3SR - Laboratoire sols, solides, structures - risques [Grenoble]
21 Service de Médecine interne A et polyclinique médicale [CHU Limoges]
Xiaosen Xiao
- Fonction : Auteur
Rasmus Rasmussen
- Fonction : Auteur
Line Li
- Fonction : Auteur
Stinus Li
- Fonction : Auteur
Thibaut Jombart
- Fonction : Auteur
- PersonId : 926089
Weiwei Zhai
- Fonction : Auteur
- PersonId : 771170
- ORCID : 0000-0001-7938-0226
Anders Eriksson
- Fonction : Auteur
- PersonId : 771171
- ORCID : 0000-0003-3436-3726
Andrea Manica
- Fonction : Auteur
- PersonId : 771172
- ORCID : 0000-0003-1895-450X
Ludovic Orlando
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1083415
- IdHAL : ludovicorlando
- ORCID : 0000-0003-3936-1850
- IdRef : 080106951
Francisco de La Vega
- Fonction : Auteur
Silvana Tridico
- Fonction : Auteur
Kasper Nielsen
- Fonction : Auteur
María Ávila-Arcos
- Fonction : Auteur
J. Víctor Moreno-Mayar
- Fonction : Auteur
Craig Muller
- Fonction : Auteur
Joe Dortch
- Fonction : Auteur
Thomas Gilbert
- Fonction : Auteur
- PersonId : 760342
- ORCID : 0000-0001-8270-7605
- IdRef : 148118747
Agata Wesolowska
- Fonction : Auteur
Monika Karmin
- Fonction : Auteur
Biao Wang
- Fonction : Auteur
Jun Li
- Fonction : Auteur
- PersonId : 755190
- ORCID : 0000-0002-0043-3506
Shuaishuai Tai
- Fonction : Auteur
Tsunehiko Hanihara
- Fonction : Auteur
George van Driem
- Fonction : Auteur
Aashish Jha
- Fonction : Auteur
François-Xavier Ricaut
- Fonction : Auteur
- PersonId : 181458
- IdHAL : francois-xavier-ricaut
- ORCID : 0000-0001-7609-7898
- IdRef : 139293590
Andrea Migliano
- Fonction : Auteur
Irene Gallego Romero
- Fonction : Auteur
Karsten Kristiansen
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757952
- ORCID : 0000-0002-6024-0917
David Lambert
- Fonction : Auteur
Peter Forster
- Fonction : Auteur
Bernd Brinkmann
- Fonction : Auteur
Olaf Nehlich
- Fonction : Auteur
Michael Bunce
- Fonction : Auteur
Richard Richards
- Fonction : Auteur
Ramneek Gupta
- Fonction : Auteur
Carlos D. Bustamante
- Fonction : Auteur
- PersonId : 875256
Anders Krogh
- Fonction : Auteur
Robert Foley
- Fonction : Auteur
M. Rasmussen
- Fonction : Auteur
X. Guo
- Fonction : Auteur
- PersonId : 939323
- ORCID : 0000-0003-3360-3791
- IdRef : 232921113
S. Rasmussen
- Fonction : Auteur
L. Skotte
- Fonction : Auteur
S. Lindgreen
- Fonction : Auteur
M. de La Vega
- Fonction : Auteur
M. Avila-Arcos
- Fonction : Auteur
M. Gilbert
- Fonction : Auteur
- PersonId : 846336
A. Weinert
- Fonction : Auteur
X. Ricaut
- Fonction : Auteur
M. Richards
- Fonction : Auteur
A. Foley
- Fonction : Auteur
Résumé
We present an Aboriginal Australian genomic sequence obtained from a 100-year-old lock of hair donated by an Aboriginal man from southern Western Australia in the early 20th century. We detect no evidence of European admixture and estimate contamination levels to be below 0.5%. We show that Aboriginal Australians are descendants of an early human dispersal into eastern Asia, possibly 62,000 to 75,000 years ago. This dispersal is separate from the one that gave rise to modern Asians 25,000 to 38,000 years ago. We also find evidence of gene flow between populations of the two dispersal waves prior to the divergence of Native Americans from modern Asian ancestors. Our findings support the hypothesis that present-day Aboriginal Australians descend from the earliest humans to occupy Australia, likely representing one of the oldest continuous populations outside Africa.