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Communication Dans Un Congrès Année : 2018

Dynamique des lésions de l'ADN

Elise Dumont

Résumé

Chaque jour, l'ADN de nos cellules subit pas moins de 10,000 réactions chimiques conduisant à son endommagement. Malgré la photostabilité de cette macromolécule et la remarquable sophistication des mécanismes de réparation présents dans les cellules, les nucléobases peuvent être modifiés pour donner lieur à plus de 70 lésions qui ont chacune été identifiées au niveau cellulaire, principalement par spectrométrie de masse. La chimie mise en jeu lors de ces réactions implique notamment des radicaux, des états excités, et/ou des sensibilisants auxquels nous sommes quotidiennement exposés. Elle reste malgré tout mal comprise car difficile à explorer aussi bien expérimentalement que théoriquement. Dans ce contexte, je montrerai que les simulations de dynamique moléculaires tout-atomes et hybrides (QM/MM-MD) permettent de sonder les mécanismes de formation, l'impact structural d'une ou plusieurs lésion(s), et les interactions potentielles avec les enzymes de réparation. Je discuterai notamment de l'importance de l'environnement biologique sur la réactivité de l'ADN, mais aussi sur la réorganisation structurale induite lors de son endommagement (hélice, puis nucléosome). Grace à nos simulations, nous sommes capables de proposer des structures permettant de rendre compte de données expérimentales, telles que des taux de réparation, effet de séquences, ou encore des taux de formation de lésion complexes. Tandis que l'ADN canonique/non lésé a été intensivement étudié pour sa photochimie 1 et sa dynamique 2 , nos simulations posent la question de la validité du champ de force pour l'ADN lésé. L'enjeu d'une description fidèle de ces lésions est de pouvoir mettre en place un véritable screening pour les lésions combinatoires les plus génotoxiques pour pouvoir ouvrir de nombreuses perspectives dans les domaines de la biologie et de la médecine, notamment dans le cadre du développement de thérapies contre le cancer.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-02061604 , version 1 (20-03-2019)

Identifiants

  • HAL Id : hal-02061604 , version 1

Citer

Elise Dumont. Dynamique des lésions de l'ADN. XVIèmes Rencontres des Chimistes Théoriciens Francophones, Oct 2018, Toulouse, France. ⟨hal-02061604⟩
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