Genome-wide association study identifies 74 loci associated with educational attainment - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Nature Année : 2016

Genome-wide association study identifies 74 loci associated with educational attainment

David A. Bennett (1) , Klaus Berger , Lars Bertram , Hans Bisgaard , Dorret I. Boomsma , Ingrid B. Borecki , Ute Bültmann , Christopher F. Chabris , Francesco Cucca , Daniele Cusi , Ian J. Deary , George V. Dedoussis , Cornelia M. Van Duijn (2) , Johan G. Eriksson , Barbara Franke , Lude Franke , Paolo Gasparini , Pablo V. Gejman , Christian Gieger (3) , Hans-Jörgen Grabe , Jacob Gratten (4) , Patrick J. F. Groenen (5) , Vilmundur Gudnason , Pim van Der Harst , Caroline Hayward , David A. Hinds , Wolfgang Hoffmann (6) , Elina Hyppönen , William G. Iacono , Bo Jacobsson , Marjo-Riitta Järvelin , Karl-Heinz Jöckel , Jaakko Kaprio (7) , Sharon L. R. Kardia , Terho Lehtimäki , Steven F. Lehrer , Patrik K. E. Magnusson , Nicholas G. Martin , Matt Mcgue , Andres Metspalu , Neil Pendleton , Brenda W. J. H. Penninx , Markus Perola (8) , Nicola Pirastu , Mario Pirastu (9) , Ozren Polasek , Danielle Posthuma , Christine Power , Michael A. Province , Nilesh J. Samani , David Schlessinger , Reinhold Schmidt , Thorkild I. A. Sørensen , Tim D. Spector , Kari Stefansson , Unnur Thorsteinsdottir , A. Roy Thurik (5, 10) , Nicholas J. Timpson , Henning Tiemeier , Joyce Y. Tung , André G. Uitterlinden (11) , Veronique Vitart , Peter Vollenweider , David R. Weir , James F. Wilson , Alan F. Wright , Dalton C. Conley , Robert F. Krueger , George Davey Smith (12) , Albert Hofman , David I. Laibson , Sarah E. Medland (13) , Michelle N. Meyer , Jian Yang , Magnus Johannesson , Peter M. Visscher , Tõnu Esko , Philipp D. Koellinger , David Cesarini , Daniel J. Benjamin , Aysu Okbay , Jonathan P. Beauchamp , Mark Alan Fontana , James J. Lee , Tune H. Pers , Cornelius A. Rietveld , Patrick Turley (14) , Guo-Bo Chen , Valur Emilsson , S. Fleur W. Meddens , Sven Oskarsson , Joseph K. Pickrell , Kevin Thom , Pascal Timshel , Ronald De Vlaming , Abdel Abdellaoui , Tarunveer S. Ahluwalia , Jonas Bacelis , Clemens Baumbach , Gyda Bjornsdottir , Johannes H. Brandsma , Maria Pina Concas , Jaime Derringer , Nicholas A. Furlotte , Tessel E. Galesloot , Giorgia Girotto , Richa Gupta , Leanne M. Hall , Sarah E. Harris , Edith Hofer (15) , Momoko Horikoshi , Jennifer E. Huffman , Kadri Kaasik , Ioanna P. Kalafati , Robert Karlsson , Augustine Kong , Jari Lahti , Sven J. van Der Lee , Christiaan Deleeuw , Penelope A. Lind , Karl-Oskar Lindgren , Tian Liu (16) , Massimo Mangino (17) , Jonathan Marten , Evelin Mihailov , Michael B. Miller , Peter J. van Der Most , Christopher Oldmeadow , Antony Payton , Natalia Pervjakova , Wouter J. Peyrot , Yong Qian , Olli Raitakari (18, 19) , Rico Rueedi , Erika Salvi , Börge Schmidt , Katharina E. Schraut , Jianxin Shi , Albert V. Smith , Raymond A. Poot , Beate St Pourcain , Alexander Teumer (17) , Gudmar Thorleifsson , Niek Verweij , Dragana Vuckovic , Juergen Wellmann , Harm-Jan Westra , Jingyun Yang , Wei Zhao (20) , Zhihong Zhu , Behrooz Z. Alizadeh , Najaf Amin , Andrew Bakshi , Sebastian E. Baumeister , Ginevra Biino , Klaus Bønnelykke , Patricia A. Boyle , Harry Campbell (21) , Francesco P. Cappuccio , Gail Davies , Jan-Emmanuel de Neve , Panos Deloukas , Ilja Demuth (22) , Jun Ding , Peter Eibich , Lewin Eisele , Niina Eklund , David M. Evans (23) , Jessica D. Faul , Mary F. Feitosa , Andreas J. Forstner , Ilaria Gandin , Bjarni Gunnarsson , Bjarni V. Halldórsson (24) , Tamara B. Harris , Andrew C. Heath , Lynne J. Hocking , Elizabeth G. Holliday , Georg Homuth , Michael A. Horan , Jouke-Jan Hottenga (17) , Philip L. De Jager , Peter K. Joshi , Astanand Jugessur , Marika A. Kaakinen , Mika Kähönen , Stavroula Kanoni , Liisa Keltigangas-Järvinen , Lambertus A. L. M. Kiemeney , Ivana Kolcic , Seppo Koskinen , Aldi T. Kraja , Martin Kroh , Zoltan Kutalik , Antti Latvala , Lenore J. Launer (25) , Maël P. Lebreton , Douglas F. Levinson , Paul Lichtenstein (26) , Peter Lichtner , David C. M. Liewald , Lifelines Cohort Study , Anu Loukola , Pamela A. Madden , Reedik Mägi , Tomi Mäki-Opas , Riccardo E. Marioni , Pedro Marques-Vidal , Gerardus A. Meddens , George Mcmahon , Christa Meisinger , Thomas Meitinger , Yusplitri Milaneschi , Lili Milani , Grant W. Montgomery (13) , Ronny Myhre , Christopher P. Nelson (27) , Dale R. Nyholt , William E. R. Ollier , Aarno Palotie (28, 14) , Lavinia Paternoster , Nancy L. Pedersen (29) , Katja E. Petrovic , David J. Porteous , Katri Räikkönen , Susan M. Ring , Antonietta Robino , Olga Rostapshova , Igor Rudan , Aldo Rustichini , Veikko Salomaa , Alan R. Sanders , Antti-Pekka Sarin , Helena Schmidt (30) , Rodney J. Scott , Blair H. Smith , Jennifer A. Smith , Jan A. Staessen , Elisabeth Steinhagen-Thiessen (22) , Konstantin Strauch , Antonio Terracciano (31) , Martin D. Tobin , Sheila Ulivi , Simona Vaccargiu , Lydia Quaye , Frank J. A. Van Rooij , Cristina Venturini , Anna A. E. Vinkhuyzen , Uwe Völker , Henry Völzke , Judith M. Vonk , Diego Vozzi , Johannes Waage (32) , Erin B. Ware , Gonneke Willemsen , John R. Attia
1 Rush University Medical Center [Chicago]
2 Department of Epidemiology [Rotterdam]
3 HMGU - Helmholtz Zentrum München = German Research Center for Environmental Health
4 UQ [All campuses : Brisbane, Dutton Park Gatton, Herston, St Lucia and other locations] - The University of Queensland
5 Erasmus University Rotterdam
6 UNAV - Universidad de Navarra [Pamplona]
7 National Institute for Health and Welfare [Helsinki]
8 FIMM - Institute for Molecular Medicine Finland [Helsinki]
9 CNR - National Research Council of Italy | Consiglio Nazionale delle Ricerche
10 MRM - Montpellier Research in Management
11 Erasmus MC - Erasmus University Medical Center [Rotterdam]
12 University of Bristol [Bristol]
13 Queensland Institute of Medical Research
14 Massachusetts General Hospital [Boston]
15 Medical University of Graz = Medizinische Universität Graz
16 ISM - Institut des Sciences Moléculaires
17 King‘s College London
18 Tampere University Hospital
19 University of Turku
20 AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris]
21 Edin. - University of Edinburgh
22 Charité - UniversitätsMedizin = Berlin University Medicine
23 Imperial College London
24 Reykjavík University
25 Donders Institute for Brain, Cognition and Behaviour
26 Karolinska Institutet [Stockholm]
27 Department of Health Sciences [Leicester]
28 BROAD INSTITUTE - Broad Institute of MIT and Harvard
29 MEB - Department of Medical Epidemiology and Biostatistics
30 Dpt of Pharmacology and Personalised Medicine [Maastricht]
31 FSU - Florida State University [Tallahassee]
32 ITU - IT University of Copenhagen
Klaus Berger
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Lars Bertram
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Hans Bisgaard
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Dorret I. Boomsma
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Ingrid B. Borecki
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Ute Bültmann
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Christopher F. Chabris
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Francesco Cucca
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Daniele Cusi
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Ian J. Deary
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George V. Dedoussis
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Johan G. Eriksson
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Barbara Franke
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Lude Franke
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Paolo Gasparini
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Pablo V. Gejman
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Hans-Jörgen Grabe
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Vilmundur Gudnason
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Pim van Der Harst
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Caroline Hayward
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David A. Hinds
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Elina Hyppönen
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William G. Iacono
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Bo Jacobsson
Marjo-Riitta Järvelin
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Karl-Heinz Jöckel
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Sharon L. R. Kardia
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Terho Lehtimäki
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Steven F. Lehrer
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Patrik K. E. Magnusson
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Nicholas G. Martin
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Matt Mcgue
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Andres Metspalu
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Neil Pendleton
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David Schlessinger
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Reinhold Schmidt
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Joyce Y. Tung
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Cornelius A. Rietveld
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Valur Emilsson
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Abdel Abdellaoui
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Clemens Baumbach
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Gyda Bjornsdottir
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Johannes H. Brandsma
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Maria Pina Concas
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Jaime Derringer
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Nicholas A. Furlotte
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Tessel E. Galesloot
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Giorgia Girotto
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Richa Gupta
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Leanne M. Hall
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Sarah E. Harris
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Momoko Horikoshi
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Kadri Kaasik
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Ioanna P. Kalafati
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Jari Lahti
Sven J. van Der Lee
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Christiaan Deleeuw
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Penelope A. Lind
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Karl-Oskar Lindgren
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Michael B. Miller
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Peter J. van Der Most
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Christopher Oldmeadow
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Antony Payton
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Natalia Pervjakova
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Wouter J. Peyrot
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Yong Qian
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Rico Rueedi
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Börge Schmidt
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Katharina E. Schraut
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Jianxin Shi
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Albert V. Smith
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Raymond A. Poot
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Beate St Pourcain
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Gudmar Thorleifsson
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Niek Verweij
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Dragana Vuckovic
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Juergen Wellmann
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Harm-Jan Westra
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Jingyun Yang
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Panos Deloukas
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Stavroula Kanoni
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Liisa Keltigangas-Järvinen
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Lambertus A. L. M. Kiemeney
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Ivana Kolcic
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Aldi T. Kraja
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Martin Kroh
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Zoltan Kutalik
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Antti Latvala
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Maël P. Lebreton
Douglas F. Levinson
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Peter Lichtner
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David C. M. Liewald
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Lifelines Cohort Study
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Anu Loukola
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Pamela A. Madden
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Reedik Mägi
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Tomi Mäki-Opas
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Riccardo E. Marioni
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Pedro Marques-Vidal
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Gerardus A. Meddens
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George Mcmahon
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Christa Meisinger
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Thomas Meitinger
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Yusplitri Milaneschi
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Lili Milani
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Ronny Myhre
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Dale R. Nyholt
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William E. R. Ollier
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Lavinia Paternoster
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Katja E. Petrovic
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David J. Porteous
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Katri Räikkönen
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Susan M. Ring
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Antonietta Robino
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Olga Rostapshova
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Igor Rudan
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Aldo Rustichini
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Veikko Salomaa
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Alan R. Sanders
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Antti-Pekka Sarin
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Rodney J. Scott
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Blair H. Smith
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Jennifer A. Smith
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Jan A. Staessen
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Konstantin Strauch
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Martin D. Tobin
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Sheila Ulivi
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Simona Vaccargiu
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Lydia Quaye
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Frank J. A. Van Rooij
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Cristina Venturini
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Anna A. E. Vinkhuyzen
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Uwe Völker
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Henry Völzke
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Judith M. Vonk
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Diego Vozzi
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Erin B. Ware
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Gonneke Willemsen
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John R. Attia
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Résumé

Educational attainment is strongly influenced by social and other environmental factors, but genetic factors are estimated to account for at least 20% of the variation across individuals1. Here we report the results of a genome-wide association study (GWAS) for educational attainment that extends our earlier discovery sample1,2 of 101,069 individuals to 293,723 individuals, and a replication study in an independent sample of 111,349 individuals from the UK Biobank. We identify 74 genome-wide significant loci associated with the number of years of schooling completed. Single-nucleotide polymorphisms associated with educational attainment are disproportionately found in genomic regions regulating gene expression in the fetal brain. Candidate genes are preferentially expressed in neural tissue, especially during the prenatal period, and enriched for biological pathways involved in neural development. Our findings demonstrate that, even for a behavioural phenotype that is mostly environmentally determined, a well-powered GWAS identifies replicable associated genetic variants that suggest biologically relevant pathways. Because educational attainment is measured in large numbers of individuals, it will continue to be useful as a proxy phenotype in efforts to characterize the genetic influences of related phenotypes, including cognition and neuropsychiatric diseases.
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David A. Bennett, Klaus Berger, Lars Bertram, Hans Bisgaard, Dorret I. Boomsma, et al.. Genome-wide association study identifies 74 loci associated with educational attainment. Nature, 2016, 533 (7604), pp.539-542. ⟨10.1038/nature17671⟩. ⟨hal-02017372⟩
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