HIV-1 subtype B-infected MSM may have driven the spread of transmitted resistant strains in France in 2007–12: impact on susceptibility to first-line strategies - Archive ouverte HAL Access content directly
Journal Articles Journal of Antimicrobial Chemotherapy Year : 2015

HIV-1 subtype B-infected MSM may have driven the spread of transmitted resistant strains in France in 2007–12: impact on susceptibility to first-line strategies

Pierre Frange (1) , Pierre Assoumou , Diane Descamps (2) , Antoine Chéret (3) , Cécile Goujard (4) , Laurent Tran , Marine Gousset (5) , Véronique Avettand-Fenoël (3) , Laurence Bocket (6) , Samira Tran , Jérôme Guinard (7) , Pierre Morand-Joubert , Florence Nicot (8) , Jean-Christophe Plantier (9) , Sylvie Rogez (10) , Pierre Wirden , Christine Rouzioux (11) , Laurence Meyer (4) , Marie-Laure Chaix (3) , S. Abel (12) , B. Abraham , A. Antoniotti , R. Armero , B. Audhuy , H. Aumaitre , G. Beaucaire , G. Beck-Wirth , J.L. Berger , L. Bernard (13) , C. Beuscart , L. Bodard , O. Bouchaud , F. Boue (14) , J.-P. Cabane , A. Cabié (15) , H. Champagne , C. Cheneau , J.-M. Chennebault (16) , A. Cheret , B. Christian , A. Compagnucci , V. Daneluzzi , Y. Debab , P. Dellamonica (17) , F. Delfraissy , A. Devidas , G. Diab , J. Doll , C. Drobacheff-Thebaut , A. Durel , L. Esnault , L. Faba , E. Froguel , D. Garipuy , V. Garrait , L. Geffray , C. Genet (18) , P. Genet , L. Gérard , J. Ghosn (19) , J. Girard , Pascal Girard , C. Godin-Collet , P. Hochedez , B. Hoen (20) , D. Houlbert , C. Jacomet , V. Jeantils (21) , K. Jidar , E. Klement , A. Lafeuillade , V. Launay , A. Leprêtre (22) , Y. Levy (23) , D. Makhloufi , D. Malbec , B. Martha (24) , T. May (25) , D. Merrien , P. Miailhes (26) , C. Miodovski , P. Morlat , E. Mortier (27) , D. Neau , M. Obadia , O. Patey , L. Pellegrin (28) , V. Perronne , P. Philibert (29) , G. Pialoux , G. Pichancourt , L. Piroth (30) , Y. Poinsignon , I. Poizot-Martin (31) , T. Prazuck (32) , V. Prendki , F. Du Clary , D. Quinsat (33) , A. Regnier (34) , J. Reynes (35) , E. Rosenthal (17) , E. Rouveix , D. Salmon (36) , F. Salanville , L. Schmitt , A. Simon-Coutellier , A. Sotto (37) , F. Souala (38) , A. Stein (39) , F. Timsit , P. de Truchis (40) , A. Uludag , O. Vaillant (41) , R. Verdon , A. Verlesch-Langlin , J.-P. Viard , D. Vittecoq , L. Weiss , P. Yéni , D. Zucman (42) , C. Allavena (43) , T. Allegre (44) , I. Amri , B. Autran (27) , C. Bacchus , C. Blanc , S. Bonne , B. Bonne , S. Bouchez , C. Charlier (45) , H. Consigny , C. Duvivier (46) , E. Fourn , F. Guiroy , T. Huleux (47) , C. Katlama (48) , C. Lascoux (49) , A. Leplatois , T. Lyavanc , J.-M. Molina (50) , A. Naqvi (51) , G. Nembot , Y. Quertainmont , F. Raffi (43) , A. Samri (52) , L. Schneider , S. Seang , B. Seksik , M. Shoai-Tehrani , L. Slama , A. Valentin , Y. Yazdanpanah (53) , C. Alloui , C. Amiel (54) , P. André (55) , E. André , G. Anies , F. Barin (33) , P. Bellecave (56) , D. Bettinger (57) , M. Bouvier-Alias (23) , F. Brun-Vézinet , A. Calmy (58) , V. Calvez (48) , W. Caveng , A. Chaillon , S. Chapalay , C. Charpentier , D. Costagliola , J. Cottalorda (59) , C. Delamare , C. Delaugerre (60) , J. Dina , G. Santos , V. Ferre (61) , P. Flandre (32) , H. Fleury , S. Fourati , C. Gaille , G. Giraudeau , A. Guigon , S. Haim-Boukobza , E. Lagier , H. Le Guillou-Guillemette (62) , C. Henquell (63, 64) , Jacques Izopet (65) , Lambert Lambert-Niclot , M. Leroux , A. Maillard , I. Malet (66) , Marc Marcelin , S. Marque-Juillet , B. Masquelier (56) , A. Mirand (63, 64) , P. Morand , B Montes , L. Mouna , C. Noel , C. Pallier (67) , G. Peytavin (68) , P. Pinson-Recordon , J. Poveda , S. Raymond , S. Reigadas (56) , A. Roques (69) , A. de Rougemont (70) , C. Roussel , P. Schmitt , V. Schneider , E. Schvoerer (71) , A. Signori-Schmuck (72) , C. Soulié (48) , C. Tamalet (73) , C. Tardy , A. Trabaud , A. Vabret (74) , S. Vallet (75) , S. Yerly
1 Laboratoire de Microbiologie Clinique
2 Laboratoire de Virologie
3 Laboratoire de Virologie [CHU Necker]
4 CESP - Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations
5 Laboratoire de Microbiologie Clinique [AP-HP Hôpital Necker-Enfants Malades]
6 Laboratoire de Virologie - Laboratoire de Virologie - ULR 3610
7 Laboratoire de microbiologie [CHRU Orléans]
8 Laboratoire Virologie [CHU Toulouse]
9 CHU Rouen
10 Service de Bactériologie, Virologie, Hygiène [CHU Limoges]
11 UPD5 Médecine - Université Paris Descartes - Faculté de Médecine
12 SMPSD - Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication
13 Département de Pharmacie
14 inconnu
15 CIC - Antilles Guyane - Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane
16 Service des maladies infectieuses et tropicales
17 Hôpital l'Archet
18 Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Limoges]
19 Infectious Diseases Department
20 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
21 Hôpital Jean Verdier [AP-HP]
22 Laboratoire d'Ecologie Numérique et d'Ecotoxicologie
23 IMRB - Institut Mondor de Recherche Biomédicale
24 Infectious diseases department
25 BELL - Bell Labs
26 UNICANCER/CRCL - Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
27 U3B - Unité de Biotechnologie, Biocatalyse et Biorégulation
28 CESPA - Centre d'épidémiologie et de santé publique des armées [Marseille]
29 Département de biochimie [Montpellier]
30 Département d'infectiologie (CHU de Dijon)
31 Hôpitaux Sud - Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM]
32 iPLESP - Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique
33 IBCP - Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon]
34 STMicroelectronics
35 IMEP - Institut Méditerranéen d'Ecologie et de Paléoécologie
36 service pharmaceutique Hôpital Edouard Herriot, Hospices Civils de Lyon
37 VBMI - Virulence bactérienne et maladies infectieuses
38 Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes] = Infectious Disease and Intensive Care [Rennes]
39 Université de stuttgart
40 Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP]
41 IBMM - Institut des Biomolécules Max Mousseron [Pôle Chimie Balard]
42 Hôpital Foch [Suresnes]
43 Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes]
44 Centre Hospitalier du Pays d'Aix
45 UR NIGR - Nivologie
46 Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker]
47 Centre Hospitalier Tourcoing
48 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
49 Service de radiologie [Saint-Louis]
50 Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Saint Louis]
51 CHU Nice - Centre Hospitalier Universitaire de Nice
52 INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
53 UMR CNRS 8179
54 ERPCB - Equipe de Recherche en Physico-Chimie et Biotechnologie
55 CIML - Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy
56 MFP - Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
57 CHRU Besançon - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon
58 HUG - Geneva University Hospital
59 Service de chirurgie pédiatrique [Hôpital Lapeyronie-Arnaud de Villeneuve]
60 Service de microbiologie [Saint-Louis]
61 CHU Nantes - Centre Hospitalier Universitaire de Nantes
62 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
63 CHU Clermont-Ferrand
64 LMGE - Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement
65 CPTP - Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan
66 Epidémiologie, stratégies thérapeutiques et virologie cliniques dans l'infection à VIH
67 LCogn - Neuroimagerie cognitive
68 IAME (UMR_S_1137 / U1137) - Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution
69 INRA - Institut National de la Recherche Agronomique
70 PAM - Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon]
71 Service de Virologie [CHRU Nancy]
72 UVHCI - Unit of Virus Host Cell Interactions = Biologie structurale des interactions entre virus et cellule hôte
73 URMITE - Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes
74 Laboratoire de Virologie Humaine et Moléculaire [Caen]
75 LUBEM - Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne
Pierre Assoumou
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Laurent Tran
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Samira Tran
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Pierre Morand-Joubert
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Florence Nicot
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Jean-Christophe Plantier
Pierre Wirden
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B. Abraham
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A. Antoniotti
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R. Armero
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B. Audhuy
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H. Aumaitre
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G. Beaucaire
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G. Beck-Wirth
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J.L. Berger
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C. Beuscart
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L. Bodard
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O. Bouchaud
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F. Boue
J.-P. Cabane
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H. Champagne
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C. Cheneau
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A. Cheret
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B. Christian
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A. Compagnucci
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V. Daneluzzi
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Y. Debab
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P. Dellamonica
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F. Delfraissy
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A. Devidas
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G. Diab
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J. Doll
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C. Drobacheff-Thebaut
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A. Durel
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L. Esnault
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L. Faba
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E. Froguel
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D. Garipuy
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V. Garrait
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L. Geffray
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P. Genet
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L. Gérard
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J. Girard
Pascal Girard
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C. Godin-Collet
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P. Hochedez
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D. Houlbert
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C. Jacomet
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K. Jidar
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E. Klement
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A. Lafeuillade
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V. Launay
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D. Makhloufi
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D. Malbec
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T. May
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D. Merrien
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P. Miailhes
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C. Miodovski
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P. Morlat
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D. Neau
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M. Obadia
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O. Patey
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V. Perronne
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G. Pialoux
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G. Pichancourt
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Y. Poinsignon
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V. Prendki
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L. Schmitt
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D. Vittecoq
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B. Bonne
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C. Charlier
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L. Schneider
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S. Seang
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L. Slama
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A. Valentin
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Y. Yazdanpanah
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C. Alloui
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E. André
G. Anies
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F. Brun-Vézinet
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W. Caveng
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A. Chaillon
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S. Chapalay
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C. Charpentier
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D. Costagliola
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C. Delamare
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C. Delaugerre
J. Dina
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G. Santos
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H. Fleury
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S. Fourati
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C. Gaille
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G. Giraudeau
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S. Haim-Boukobza
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Jacques Izopet
Lambert Lambert-Niclot
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M. Leroux
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A. Maillard
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Marc Marcelin
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S. Marque-Juillet
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P. Morand
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B Montes
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L. Mouna
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C. Noel
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P. Pinson-Recordon
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J. Poveda
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S. Raymond
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C. Roussel
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P. Schmitt
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V. Schneider
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E. Schvoerer
C. Soulié
C. Tardy
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A. Trabaud
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S. Yerly
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Abstract

Background: Our study describes the prevalence of transmitted drug resistance (TDR) among 1318 French patients diagnosed at the time of primary HIV-1 infection (PHI) in 2007-12. Methods: HIV-1 resistance-associated mutations (RAMs) were characterized using both the 2009 WHO list of mutations and the French ANRS algorithm. A genotypic susceptibility score was estimated for each first-line recommended ART combination. Results: Patients were mainly MSM (72.6%). Non-B variants were identified in 33.7% of patients. The proportion of TDR was estimated as 11.7% (95% CI 10.0-13.5). The prevalences of PI-, NRTI-, first-generation NNRTI and etravirine/rilpivirine-associated RAMs were 2.5%, 5.2%, 3.9% and 3.2%, respectively. Single, dual and triple class resistance was found in 9.6%, 1.0% and 1.1% of cases, respectively. Additionally, 5/331 strains isolated in 201012 had integrase inhibitor (II)-related RAMs (isolated E157Q mutation in all cases). TDR was more common among MSM than in other groups (12.9% versus 8.6%, P = 0.034), and in case of B versus non-B subtype infections (13.6% versus 7.9%, P = 0.002). The proportions of fully active combinations were >= 99.2%, >= 97.3% and >= 95.3% in cases of PI-, II- and NNRTI-based regimens, respectively. In 2010-12, the proportion of fully active efavirenz-based ART was lower in cases of subtype B versus non-B infection (P = 0.021). Conclusions: Compared with our previous studies, the proportion of NRTI- and first-generation NNRTI-related TDR has continued to decline in French seroconverters. However, subtype B-infected MSM could drive the spread of resistant HIV strains. Finally, we suggest preferring PI- or II- to NNRTI-based combinations to treat PHI patients.

Dates and versions

hal-01983697 , version 1 (16-01-2019)

Identifiers

Cite

Pierre Frange, Pierre Assoumou, Diane Descamps, Antoine Chéret, Cécile Goujard, et al.. HIV-1 subtype B-infected MSM may have driven the spread of transmitted resistant strains in France in 2007–12: impact on susceptibility to first-line strategies. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2015, 70 (7), pp.2084-2089. ⟨10.1093/jac/dkv049⟩. ⟨hal-01983697⟩
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