Dans cet article, nous proposons une analyse de l’efficience des institutions de microfinance (IMF) dans la zone UEMOA. L’analyse est faite à partir d’une approche DEA en deux étapes. Dans la première étape, l’efficience des IMF est estimée de façon non paramétrique, en exécutant un modèle VRS (de rendements d’échelle variables) à orientation input. Au total six modèles d’efficience sont estimés dont trois concernent l’efficience financière et trois autres, l’efficience sociale. Les scores d’efficience obtenus dans cette première étape sont régressés, dans la seconde étape, sur un ensemble de variables environnementales en suivant la procédure bootstrap truncated de Simar et Wilson [2007], plus robuste que les approches classiques basées sur la régression tobit ou les moindres carrées ordinaires. Les résultats de la première étape mettent en évidence une faible efficience des IMF de la zone UEMOA. L’inefficience est à la fois technique et d’échelle, mais s’explique davantage par une mauvaise combinaison technique des ressources. Elle est plus palpable sur le plan social que financier. Les résultats de l’estimation post-dea montrent que la rentabilité économique est un déterminant essentiel de l’efficience financière et sociale. Les IMF les plus rentables économiquement sont les plus efficientes tant au plan social que financier. Les IMF les plus grandes et les plus anciennes sont également les moins efficientes au plan social. De même les IMF à profil non commercial sont les plus efficientes du point de vue social. Toutefois, les résultats montrent que les variables environnementales ont souvent un impact qui varie selon le type de modèle spécifié.