Le secteur de la « Bassée amont », qui présente un intérêt écologique majeur à l’échelle de l’Île-de-France, est aujourd’hui menacé par les impacts potentiels de projets d’aménagements. Dans ce cadre, la partie amont de la plaine alluviale de la vallée de la Seine, a fait l’objet en 2014 et 2015 d’un programme d’amélioration des connaissances sur les végétations, qui vient ainsi compléter des travaux plus anciens. Les prospections de terrain ont permis la cartographie de 3 451 hectares d’habitats naturels à l’échelle du 1/5000ème. Le CBNBP a ainsi pu distinguer 40 alliances et 67 associations phytosociologiques, ce qui représente respectivement 28% des alliances et 15 % des associations présentes ou potentielles en Île-de-France. De plus, 32 alliances ont été reconnues d’intérêt communautaire et/ou patrimonial soit 82,5% des alliances inventoriées. Chacune fait l’objet d’une fiche adaptée au contexte local. L’apport de cette étude est incontestable sur l’estimation des végétations non spatiales (linéaire ou ponctuelle) souvent sous-estimés dans les travaux antérieurs de cartographie de végétations. Près de 35% de la surface inventoriée (soit plus de 1 200 ha) est constituée d’habitats d’intérêt communautaire. Au total, dix habitats d’intérêt communautaire dont deux d’intérêt communautaire prioritaire ont été déterminés. Cependant les résultats montrent que seule une petite proportion des habitats Natura 2000 présentent un bon état de conservation, tandis qu’une grande majorité est jugée en état de conservation mauvais ou moyen. Le bilan floristique recense 676 taxons après 2000 sur le territoire dont 520 ont été notés dans le cadre de ce programme. Parmi ces taxons, 59 sont considérés comme patrimoniaux dont neuf sont protégées au niveau national et 14 au niveau régional.