Literature-based discovery: Signaling Systems in Systemic Biology
Apprendre de la littérature scientifique : Les réseaux de signalisation en biologie systémique
Résumé
This paper aims to prove the feasibility of a text mining system to provide an inference engine that builds a signaling system in Systemic Biology. This engine uses predicates extracted from scientific papers. Our text mining system proceeds in two steps. First, it searches interesting sentences in a big scientific corpus. Second, it automatically builds predicates from these sentences. These two steps use finite state transducer cascades.
Cet article a pour but de montrer la faisabilité d'un système de fouille de texte pour alimenter un moteur d'inférences capable de construire, à partir de prédicats extraits des articles scientifiques, un réseau de signalisation en biologie systémique. Cette fouille se réalise en deux étapes : la recherche de phrases d'intérêt dans un grand corpus scientifique, puis la construction automatique de prédicats. Ces deux étapes utilisent un système de cascades de transducteurs.