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Article Dans Une Revue eLife Année : 2018

Transcriptomic analyses reveal rhythmic and CLOCK-driven pathways in human skeletal muscle

Laurent Perrin
Ursula Loizides-Mangold
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Cédric Gobet
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Nicolas Hulo
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Laura Isenegger
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Benjamin D Weger
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Eugenia Migliavacca
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Aline Charpagne
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James A Betts
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Jean-Philippe Walhin
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Iain Templeman
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Keith Stokes
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Dylan Thompson
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Kostas Tsintzas
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Cedric Howald
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Howard Riezman
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Jerome N Feige
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Leonidas G Karagounis
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Jonathan D Johnston
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Emmanouil T Dermitzakis
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Frédéric Gachon
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Charna Dibner
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Résumé

Circadian regulation of transcriptional processes has a broad impact on cell metabolism. Here, we compared the diurnal transcriptome of human skeletal muscle conducted on serial muscle biopsies in vivo with profiles of human skeletal myotubes synchronized in vitro. More extensive rhythmic transcription was observed in human skeletal muscle compared to in vitro cell culture as a large part of the in vivo mRNA rhythmicity was lost in vitro. siRNA-mediated clock disruption in primary myotubes significantly affected the expression of similar to 8% of all genes, with impact on glucose homeostasis and lipid metabolism. Genes involved in GLUT4 expression, translocation and recycling were negatively affected, whereas lipid metabolic genes were altered to promote activation of lipid utilization. Moreover, basal and insulin-stimulated glucose uptake were significantly reduced upon CLOCK depletion. Our findings suggest an essential role for the circadian coordination of skeletal muscle glucose homeostasis and lipid metabolism in humans.

Dates et versions

hal-01847497 , version 1 (23-07-2018)

Identifiants

Citer

Laurent Perrin, Ursula Loizides-Mangold, Stéphanie Chanon, Cédric Gobet, Nicolas Hulo, et al.. Transcriptomic analyses reveal rhythmic and CLOCK-driven pathways in human skeletal muscle. eLife, 2018, 7, pp.30. ⟨10.7554/eLife.34114⟩. ⟨hal-01847497⟩
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