Entre les lettres patentes de mars 1593 par lesquelles Henri IV accorde à Philippe Duplessis-Mornay l’autorisation de « faire construire, ériger et bâtir un collège » à Saumur et, en 1613, la tenue d’un registre « des affaires de l’académie », vingt années s’écoulent au cours desquelles le gouverneur de Saumur se bat pour l’ouverture d’un collège de plein exercice et, à partir de 1606, d’une académie pour la formation théologique des pasteurs. C’est donc un établissement composé de deux corps distincts, celui du collège et de ses régents avec un principal à sa tête, celui de l’académie et de ses professeurs dirigés par un recteur, qui fonctionne du début du XVIIe siècle jusqu’à l’arrêt du conseil du 8 janvier 1685 « portant extinction et suppression du collège et Académie » .
À Saumur, on peut distinguer quatre principales institutions réformées qui interviennent dans le domaine éducatif : le collège de plein exercice, l’académie en tant que telle donnant une formation théologique, le consistoire, mais aussi jusqu’au début des années 1620 le gouverneur qui est omniprésent dans le fonctionnement de l’institution scolaire. Mais synodes nationaux et synodes provinciaux jouent également un rôle dans le système scolaire .
Malgré cette distinction collège d’une part, académie d’autre part, les deux corps sont étroitement liés, autant sur un plan institutionnel que dans la vie quotidienne. Ce sont ces relations étroites que nous proposons d’étudier en s’appuyant principalement sur trois sources essentielles : les registres de l’académie qui couvrent les années 1613-1673, puis les années 1683-1684 , le livre des recettes de l’académie pour les années 1631-1685 , les actes des synodes provinciaux d’Anjou-Touraine-Maine qui ont été retrouvés, soit de 1594 pour les plus anciens à 1683, année du dernier synode tenu par la province . Quelle valeur peut-on attribuer à cette distinction collège-académie ? Peut-on considérer que l’institution traite différemment les deux corps ? Au sein des deux corps, cette distinction est-elle ressentie et faite ? Ces différentes questions peuvent être abordées à partir du cadre institutionnel existant, puis de la volonté de mettre en avant ces deux corps, et enfin de voir quels sont les autres éléments d’opposition entre collège et académie.