Cet article traite des problèmes méthodologiques rencontrés dans la recherche qualitative sur le domaine militaire. Il est fondé sur une recherche sur la politique européenne de défense et de sécurité, portant en particulier sur le rôle des officiers et des diplomates français et allemands dans sa conception et sa mise en œuvre. Il aborde en premier lieu la stratégie de recherche qualitative et les questions que cela soulève, étant donné la spécificité du discours militaire. Cela soulève la question du comment interviewer des agents de la défense (pour la plupart officiers militaires et diplomates) et les encourager à parler, sans les amener à rompre leur devoir de confidentialité. Le second problème est de savoir comment construire une recherche comparative. Le dernier problème abordé dans cet article est celui de la réflexivité, et plus précisément la position du chercheur ou de la chercheuse dans son dialogue avec les officiers militaires. Que signifie la réflexivité et comment cela affecte-t-il la recherche en train de se faire? Ce problème de la réflexivité a deux aspects. Le premier est la position du chercheur, en tant que civil et universitaire: ceci soulève le problème des langages particuliers utilisés par les militaires et les universitaires. Le second est l’effet du genre du chercheur dans un monde principalement masculin.