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Poster De Conférence Année : 2017

Les plateformes analytiques d’AnaEE-France : des outils au service de la connaissance de la biodiversité

Résumé

AnaEE-France (Analyses et Expérimentations sur les Ecosystèmes – France, https://www.anaee-france.fr/) est une infrastructure nationale de recherche dédiée à l’étude des écosystèmes continentaux et de leur biodiversité. Elle met à la disposition de la communauté scientifique internationale des plateformes expérimentales (en milieu contrôlé, semi-naturel ou naturel), des plateformes d’analyses et d’instrumentation partagée. AnaEE France permet aussi un accès aux données et à des plateformes de modélisation. Dans cette infrastructure, les plateformes d’analyse biochimique et génomique, telles que Biochem-Env (https://www.biochemenv.fr/), GenoSol (https://www2.dijon.inra.fr/plateforme_genosol/), eDNA (http://www-leca.ujf-grenoble.fr/moyens-techniques/les-plateaux-techniques/article/edna) et Génomique Environnementale et Humaine (https://geh.univ-rennes1.fr/), sont des outils complémentaires de collecte de données pour la connaissance de la biodiversité. Plus particulièrement, elles permettent de suivre l’évolution de la composition, de la diversité génétique et fonctionnelle de communautés microbiennes sous contraintes : adaptation, altération de groupes microbiens. Elles permettent également la déconstruction de réseaux (métabarcoding), les liens entre niveau de diversité horizontale et verticale des réseaux trophiques des sols et le fonctionnement de ces derniers. Elles permettent aussi la collecte/identification de taxons rares (étude de l’ADN environnemental) à différentes échelles spatiales, de quantifier à haut-débit des gènes ou l’expression de gènes, d’aborder des questionnements d’épigénétique. Ces approches offertes à couts réduits par des optimisations de protocoles contribuent à lever les verrous permettant d'accéder à la diversité connue et cryptique. Les plateformes développent leur contribution commune, selon leurs spécificités, aux programmes de recherche mis en place dans les plateformes d’observation et d’expérimentation. Au sein d’AnaEE-France, elles contribueront à la gestion et à la modélisation des données de biodiversité, en lien avec les services concernés de l’infrastructure.
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17-Ecoscope-Plateformes.pdf (1.07 Mo) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-01662242 , version 1 (04-04-2023)

Identifiants

  • HAL Id : hal-01662242 , version 1
  • PRODINRA : 415627

Citer

Christian Mougin, Nathalie Cheviron, Samuel Mondy, Pierre Taberlet, Philippe Vandenkoornhuyse. Les plateformes analytiques d’AnaEE-France : des outils au service de la connaissance de la biodiversité. Séminaire Ecoscope : Données et évaluation de la biodiversité. Quels enjeux, quels défis ?, Dec 2017, Paris, France. 2017. ⟨hal-01662242⟩
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