Depuis le milieu des années 2000, l’environnement est de plus en plus associé à la notion de qualité alimentaire. Les Indications Géographiques (IG) en garantissant un lien au territoire sont interpellées dans leur capacité à contribuer à la préservation de l’environnement. Nous nous centrons sur ce croisement et pour cela nous mobilisons une double méthodologie s’appuyant sur le concept de résilience des systèmes alimentaires liés aux territoires face aux dégradations des ressources naturelles et sur les résultats d’une enquête menée auprès de responsables d’IG en productions viticole et fruitière (concernées par des enjeux de pollutions de l’eau). Nos résultats soulignent l’existence d’une multiplicité de démarches en faveur de l’environnement à différentes échelles d’action. L’analyse de la place qu’occupe la protection des ressources naturelles à chacune de ces échelles renseigne sur les conditions de résilience des systèmes alimentaires, auxquels les IG participent.