Défenseur des idées de Linné bien avant la création du Magasin encyclopédique, Aubin-Louis Millin accorde une place non négligeable à l’histoire naturelle dans la première décennie de parution de son périodique, alors marquée par d’intenses débats sur la réforme de cette discipline. Constitué essentiellement de mémoires, recensions et nouvelles du monde savant, ce journal classe avant tout sous l’étiquette « histoire naturelle » des livres élémentaires ou encyclopédiques, témoignant du souci de divulgation des sciences de Millin. Parallèlement ce dernier, médiateur averti des nouveaux travaux en botanique, zoologie et minéralogie, évolue, prenant ses distances avec les schémas linnéens. Il propose ainsi un périodique en tension entre les recherches les plus nouvelles et les exposés synthétiques destinés à un lectorat dépassant le milieu restreint des savants.