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Communication Dans Un Congrès Année : 2014

Le séquençage du génome du porc : apport des nouvelles technologies de séquençage à la génomique et la génétique porcine

Résumé

For twenty years, the development of new technologies in molecular biology have revolutionized our knowledge of genomes and, in livestock species, have significantly improved selection via new selection genomic approaches (essentially in dairy cattle). Among the major technologies, the development of a new generation of sequencers (NGS: Next Generation Sequencing) since 2006, allows the genome sequence of any individual to be acquired. In 2008, 100 times faster than for the first human genome sequence, and also for a cost divided by 100, a second human sequence was published (Nature 452, no.7189 (2008) : 872 ‐ 876). Since this period, the data from th is high throughput technology (HTS: High Throughput Sequencing) have been accumulated for many species and new extremely varied applications in fundamental and applied researches have been developed. In 2012, a first sequence of the pig genome was produced as part of an international consortium (Nature 491, no. 7424 (2012): 393 ‐ 3 98). The purpose of this communication is to make an inventory of the contribution of this technology to the study of genomes, particularly in pigs. Based on data obtained in other species, a prospective view on the impact of these new genomic data in genetics and pig breeding is also proposed.
Depuis une vingtaine d’années, l’évolution des technologies de biologie moléculaire a permis de révolutionner nos connaissances sur les génomes et, chez les animaux domestiques, d’améliorer significativement la sélection via des approches de sélection génomique (notamment chez les bovins laitiers). Parmi les développements technologiques majeurs, la mise au point d’une nouvelle génération de séquenceurs (NGS : Next Generation Sequencing) permet, depuis 2006, de déterminer la séquence individuelle de n’importe quel individu. En 2008, 100 fois plus rapidement que pour l’obtention de la première séquence du génome hu main et pour un coût également divisé par 100, une seconde séquence humaine a été publiée (Nature 452, no.7189 (2008) : 872 ‐ 876). Depuis, les données issues de cette technologie haut débit (HTS : High Throughput Sequencing) se sont accumulées pour de très nombreuses espèces et trouvent des applications dans des domaines de recherche fondamentale et appliquée extrêmement variés. En 2012, une première séquence du génome porcin a été produite dans le cadre d’un consortium international (Nature 491, no. 7424 (2012) : 393 ‐ 398). Le but de cette communication est de faire un état des lieux de l’apport de cette technologie à l’étude des génomes, plus particulièrement chez le porc. En s’appuyant sur les travaux réalisés chez d’autres espèces, une réflexion prospective sur l’impact de ces nouvelles données génomiques en génétique et en sélection porcine sera proposée.
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hal-01604152 , version 1 (03-06-2020)

Licence

Paternité - Partage selon les Conditions Initiales

Identifiants

  • HAL Id : hal-01604152 , version 1
  • PRODINRA : 407525

Citer

Bertrand Servin, Claire Gaillard, Denis Milan, Jean Pierre Bidanel, Juliette Riquet. Le séquençage du génome du porc : apport des nouvelles technologies de séquençage à la génomique et la génétique porcine. 46. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2014, Paris, France. ⟨hal-01604152⟩
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