Isolées initialement chez la souris, les cellules souches embryonnaires pluripotentes (ES) et les cellules pluripotentes induites (iPS) sont définies par leur capacité à s’auto-renouveler et à se différencier dans tous les types cellulaires d’un individu adulte, y compris la lignée germinale. Elles sont aujourd'hui cultivées en routine dans de nombreux laboratoires à partir de différentes espèces. Cependant, il a été largement montré que seules les cellules ES et iPS de souris maintiennent l’état de pluripotence naïf semblable à la masse cellulaire interne et seul capable de coloniser efficacement la lignée germinale ; De plus, in vitro, les populations de cellules pluripotentes (même dans le modèle rongeur) présentent une grande hétérogénéité phénotypique (transcriptome, capacité à coloniser un embryon, capacité à se différencier in vitro...). Il est donc nécessaire de trouver de nouveaux marqueurs pour caractériser le niveau de pluripotence des cellules générées et pour enrichir une population hétérogène en cellules capables de coloniser la lignée germinale. Il a été montré que des séquences rétrovirales endogènes (ERV), généralement silencieuses, pouvaient être spécifiquement exprimées au cours des stades précoces du développement embryonnaire. Nous avons construit des gènes rapporteurs avec des séquences promotrices inclues dans les séquences des Long Terminal Repeat (LTR) des ERV de souris, de poulet et humaine. Nous montrerons ici que ces gènes rapporteurs présentent des profils d'expression très spécifiques suggérant des différences de niveau de pluripotence en fonction de l’espèce et des conditions de culture. Ces séquences promotrices d'ERV présentent alors un potentiel considérable pour marquer et isoler des cellules pluripotentes naïves. Incluses ainsi dans des gènes rapporteurs, elles pourraient devenir un outil incontournable pour faciliter la production de cellules souches pluripotentes à partir de différentes espèces. Il est admis que les cellules embryonnaires connaissent, lors des premiers stades de développement, un remodelage chromatinien considérable et la levée de certaines marques épigénétiques permet la réactivation transcriptionelle de certains ERVs. Nous vous présenterons la stratégie de criblage d'inhibiteurs de voies épigénétiques mise en place pour décrypter les mécanismes impliqués dans la régulation de l'expression de séquence rétrovirales dans les cellules pluripotentes et pour déterminer leur rôle dans la maintenance de l'état de pluripotence naïve dans différentes espèces.