Dans les ontologies, les relations hiérarchiques de subsomption (est-un) et d'instanciation (est-l'instance-de) jouent un rôle important et sont notamment utilisées pour visualiser les ontologies sous forme de graphe. Cependant ces graphes deviennent vite illisibles lorsque les relations sont complexes et font intervenir de l'héritage multiple. C'est le cas dans l'exemple simple des acides aminés (20 acides aminés et 10 classes), mais aussi dans des applications plus complexes telles que la comparaison des propriétés des médicaments (2-10 médicaments de même indication et 10-100 classes correspondant à une propriété commune, contre-indication ou effet indésirable). Dans cet article, nous présentons les boîtes arc-en-ciel, une nouvelle technique de visualisation adaptée à la présentation des relations d'instanciation complexes et multiples dans des ontologies de faible taille. Nous décrivons l'application de cette technique aux deux exemples précédents. Nous présentons aussi une expérimentation utilisateur sur l'application médicale, montrant que les médecins accèdent plus rapidement à l'information avec les boîtes arc-en-ciel qu'avec une approche « classique » à base de tableaux.