Proceedings of the SeqBio 2015 workshop: String algorithms for bioinformatics
Actes des Journées SeqBio 2015 : Algorithmique des séquences pour la bioinformatique
Résumé
Le workshop pluridisciplinaire SeqBio 2015 s’est déroulé à l’Université Paris-Sud à Orsay le 26 et 27 novembre 2015.
Il réunit les communautés d’informatique et de bioinformatique travaillant sur les méthodes d’analyses des textes et les biologistes, génomiciens intéressés par la bioinformatique de séquences.
Grâce au financement des GdR CNRS BIM et IM, d’Inria Saclay, du LIX, de l’I2BC et du LRI, la participation est entièrement gratuite, mais obligatoire pour des raisons de capacité limitée. Le programme comprend des exposés sélectionnés sur soumission et des exposés invités.
Les thèmes abordés à SeqBio vont de la combinatoire et de l’algorithmique du texte à leurs applications à l’analyse bio-informatique des séquences biologiques. Cela inclut les sujets suivants, sans y être limité :
algorithmique du texte
structures d’indexation
combinatoire et statistiques des mots
algorithmique haute performance ou parallèle
fouille de textes
compression
alignement et recherche de similarité
recherche, découverte et inférence de motifs ou de répétitions
analyse des données de séquençage haut-débit (génomique, RNA-seq, Chip-seq, …)
annotation des génomes, prédiction de gènes
haplotypes et polymorphismes
génomique comparative
signaux de régulation
Origine | Fichiers produits par l'(les) auteur(s) |
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