Environmental microbiology as a mosaic of explored ecosystems and issues - Archive ouverte HAL
Article Dans Une Revue Environmental Science and Pollution Research Année : 2015

Environmental microbiology as a mosaic of explored ecosystems and issues

Denis Faure (1) , Patricia Bonin (2) , Robert Duran (3) , Pierre Amato (4) , Florence Arsene-Ploetze (5) , Jean-Christophe Auguet , Bernard Legrand , Philippe N. Bertin , Yvan Bettarel (6) , Aurélie Bigot-Clivot , Nicolas Blot , Manuel Blouin (7) , Myriam Bormans (8) , Marc Bouvy , Odile Bruneel , Aurélie Cébron , Urania Christaki , Ivan Couée (8) , Cristiana Cravo-Laureau (3) , Michael Danger , Julien de Lorgeril , Yves Desdevises , Yves Dessaux , Delphine Destoumieux-Garzon , Élodie Duprat , Gaël Erauso , Feth El Zahar Haichar (9) , Éric Fouilland , Andre-Jean Francez (8) , Nathalie Fromin (10) , Alain Geffard , Jean-François Ghiglione , Arnaud Huguet , Vincent Grossi (11) , Katell Guizien (12) , Ludwig Jardillier , Pascal Jouquet , Fabien Joux , Aurore Kaisermann , Oliver Kaltz , Jean-Christophe Lata , Antoine Lecerf , Corinne Leyval , Patricia Luis (9) , Estelle Masseret , Audrey Niboyet (13, 14) , Philippe Normand (9) , Frédéric Plewniak , Franck Poly (9) , Soizic Prado , Achim Quaiser (8) , Pascal Ratet , Agnès Richaume (9) , Jean-Luc Rolland , Jean-Luc Rols , Jf Rontani , Francesca Rossi , Sophie Sablé (15) , P Sivadon , Philippe Soudant (16) , Christian Tamburini , Aline Tribollet (17) , Claire Valiente Moro , France van Wambeke , Philippe Vandenkoornhuyse (2) , Stéphane Vuilleumier (5) , Philippe Vandenkoornhuyse (8)
1 I2BC - Institut de Biologie Intégrative de la Cellule
2 MIO - Institut méditerranéen d'océanologie
3 IPREM - Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l'environnement et les materiaux
4 ICCF - Institut de Chimie de Clermont-Ferrand
5 GMGM - Génétique moléculaire, génomique, microbiologie
6 Ecosym - Ecologie des systèmes marins côtiers
7 Agroécologie [Dijon]
8 ECOBIO - Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes]
9 LEM - Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557
10 CEFE - Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive
11 LGL-TPE - Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement
12 LECOB - Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
13 AgroParisTech
14 iEES Paris - Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris
15 LIENSs - LIttoral ENvironnement et Sociétés
16 LEMAR - Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR)
17 BTP - Biogéochimie-Traceurs-Paléoclimat
Denis Faure
Institut de Biologie Intégrative de la Cellule
Patricia Bonin
Institut méditerranéen d'océanologie
CV
Robert Duran
Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l'environnement et les materiaux
Pierre Amato
Institut de Chimie de Clermont-Ferrand
CV
Florence Arsene-Ploetze
Génétique moléculaire, génomique, microbiologie
CV
Jean-Christophe Auguet
Bernard Legrand
CV
Philippe N. Bertin
  • Fonction : Auteur
Yvan Bettarel
Ecologie des systèmes marins côtiers
Aurélie Bigot-Clivot
  • Fonction : Auteur
Nicolas Blot
  • Fonction : Auteur
Manuel Blouin
Agroécologie [Dijon]
CV
Myriam Bormans
Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes]
Marc Bouvy
  • Fonction : Auteur
Odile Bruneel
Aurélie Cébron
Urania Christaki
  • Fonction : Auteur
Ivan Couée
Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes]
Cristiana Cravo-Laureau
Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l'environnement et les materiaux
Michael Danger
CV
Julien de Lorgeril
Yves Desdevises
Yves Dessaux
Delphine Destoumieux-Garzon
CV
Élodie Duprat
  • Fonction : Auteur
Gaël Erauso
Feth El Zahar Haichar
Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557
Éric Fouilland
Andre-Jean Francez
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 831332
Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes]
Nathalie Fromin
Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive
Alain Geffard
Jean-François Ghiglione
Arnaud Huguet
Vincent Grossi
Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement
Katell Guizien
Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques
CV
Ludwig Jardillier
Pascal Jouquet
Fabien Joux
Aurore Kaisermann
  • Fonction : Auteur
Oliver Kaltz
Jean-Christophe Lata
Antoine Lecerf
  • Fonction : Auteur
Corinne Leyval
  • Fonction : Auteur
Patricia Luis
Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557
Estelle Masseret
  • Fonction : Auteur
Audrey Niboyet
AgroParisTech
Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris
Philippe Normand
Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557
Frédéric Plewniak
  • Fonction : Auteur
Franck Poly
  • Fonction : Auteur
Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557
Soizic Prado
Achim Quaiser
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 890917
Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes]
Pascal Ratet
Agnès Richaume
  • Fonction : Auteur
Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557
Jean-Luc Rolland
  • Fonction : Auteur
Jean-Luc Rols
  • Fonction : Auteur
Jf Rontani
Francesca Rossi
  • Fonction : Auteur
Sophie Sablé
  • Fonction : Auteur
LIttoral ENvironnement et Sociétés
P Sivadon
Philippe Soudant
Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR)
Christian Tamburini
CV
Aline Tribollet
Biogéochimie-Traceurs-Paléoclimat
Claire Valiente Moro
France van Wambeke
CV
Philippe Vandenkoornhuyse
  • Fonction : Auteur
Institut méditerranéen d'océanologie
Stéphane Vuilleumier
Génétique moléculaire, génomique, microbiologie
Philippe Vandenkoornhuyse
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 915872
Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes]

Résumé

Microbes are phylogenetically (Archaea, Bacteria, Eukarya, and viruses) and functionally diverse. They colonize highly varied environments and rapidly respond to and evolve as a response to local and global environmental changes, including those induced by pollutants resulting from human activities. This review exemplifies the Microbial Ecology EC2CO consortium’s efforts to explore the biology, ecology, diversity, and roles of microbes in aquatic and continental ecosystems.

Domaines

Biodiversité et Ecologie Environnement et Société
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viviane biou  : Connectez-vous pour contacter le contributeur

https://hal.science/hal-01247096

Soumis le : vendredi 15 janvier 2021-11:46:55

Dernière modification le : vendredi 27 décembre 2024-03:21:10

Archivage à long terme le : vendredi 16 avril 2021-18:26:29

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Dates et versions

hal-01247096 , version 1 (15-01-2021)

Licence

Paternité

Identifiants

Citer

Denis Faure, Patricia Bonin, Robert Duran, Pierre Amato, Florence Arsene-Ploetze, et al.. Environmental microbiology as a mosaic of explored ecosystems and issues. Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (18), pp.13577-13598. ⟨10.1007/s11356-015-5164-5⟩. ⟨hal-01247096⟩

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