De tout temps les milieux aquatiques ont été un vecteur d’essor de l’activité économique dans nos sociétés. Cet article propose un panorama de l’évolution des principales pressions anthropiques sur les milieux aquatiques en Bretagne. L’exercice consiste à replacer dans une perspective historique certains sujets qui font débat aujourd’hui comme la continuité écologique, la qualité de l’eau et des habitats aquatiques. Les phénomènes plus récents que sont les invasions biologiques et les changements climatiques représentent des facteurs d’instabilité future des écosystèmes aquatiques. L’évolution des écosystèmes aquatiques vers de nouveaux équilibres pourrait prendre une direction défavorable, si elle n’est anticipée, vis-à-vis des services qu’ils rendent à nos sociétés.