Genome sequence of the metazoan plant-parasitic nematode Meloidogyne incognita
Pierre Abad
(1)
,
Jerome Gouzy
(2)
,
Jean-Marc Aury
(3, 4)
,
Philippe Castagnone-Sereno
(1)
,
Etienne Danchin
(1)
,
Emeline Deleury
(1)
,
Laetitia Perfus-Barbeoch
(5)
,
Véronique Anthouard
(6)
,
François Artiguenave
(6)
,
Vivian C. Blok
(7)
,
Marie-Cécile Caillaud
(1)
,
Pedro M Coutinho
(8)
,
Corinne da Silva
(3, 4)
,
Francesca de Luca
(9)
,
Florence Deau
(1)
,
Magali Esquibet
(10)
,
Timothée Flutre
(11)
,
Jared V. Goldstone
(12)
,
Noureddine Hamamouch
(13)
,
Tarek Hewezi
(14)
,
Olivier Jaillon
(3)
,
Claire Jubin
(3)
,
Paola Leonetti
(9)
,
Marc Magliano
(1)
,
Tom R. Maier
(14)
,
Gabriel V Markov
,
Paul Mcveigh
(15)
,
Graziano Pesole
(16)
,
Julie Poulain
(6)
,
Marc Robinson-Rechavi
(17)
,
Erika Sallet
(2)
,
Béatrice Ségurens
(6)
,
Delphine Steinbach
(11)
,
Tom Tytgat
(18)
,
Edgardo Ugarte
(6)
,
Cyril van Ghelder
(1)
,
Pasqua Veronico
(9)
,
Thomas J. Baum
(14)
,
Mark Blaxter
(19)
,
Teresa Bleve-Zacheo
(9)
,
Eric L. Davis
(20)
,
J.J. Ewbank
(21)
,
Bruno Favery
(1)
,
Eric Grenier
(10)
,
Bernard Henrissat
(22)
,
John T. Jones
(7)
,
Vincent Laudet
(23)
,
Aaron G. Maule
(24)
,
Hadi Quesneville
(11)
,
Marie-Noelle Rosso
(1)
,
Thomas Schiex
(25)
,
Geert Smant
(26)
,
Jean Weissenbach
(3)
,
Patrick Wincker
(3)
1
IBSV -
Interactions Biotiques et Santé Végétale
2 LIPM - Laboratoire des interactions plantes micro-organismes
3 UMR 8030 - Génomique métabolique
4 LBGB - Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité
5 IPMSV - Interactions plantes-microorganismes et santé végétale
6 GENOSCOPE - Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
7 Scottish Crop Research Institute
8 AFMB - Architecture et fonction des macromolécules biologiques
9 Istituto per la Protezione delle Piante
10 BIO3P - Biologie des organismes et des populations appliquées à la protection des plantes
11 URGI - Unité de Recherche Génomique Info
12 WHOI - Biology Department
13 Department of Plant Pathology
14 Department of Plant Pathology
15 School of Biological Sciences
16 Dipartimento di Biochimica e Biologia moleculare
17 Department of Ecology and Evolution
18 Laboratory of Nematology
19 Institute of Evolutionary Biology
20 NC State - North Carolina State University [Raleigh]
21 CIML - Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy
22 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
23 UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1
24 School of Biolgical Sciences
25 UBIA - Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (ancêtre de MIAT)
26 WUR - Wageningen University and Research [Wageningen]
2 LIPM - Laboratoire des interactions plantes micro-organismes
3 UMR 8030 - Génomique métabolique
4 LBGB - Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité
5 IPMSV - Interactions plantes-microorganismes et santé végétale
6 GENOSCOPE - Genoscope - Centre national de séquençage [Evry]
7 Scottish Crop Research Institute
8 AFMB - Architecture et fonction des macromolécules biologiques
9 Istituto per la Protezione delle Piante
10 BIO3P - Biologie des organismes et des populations appliquées à la protection des plantes
11 URGI - Unité de Recherche Génomique Info
12 WHOI - Biology Department
13 Department of Plant Pathology
14 Department of Plant Pathology
15 School of Biological Sciences
16 Dipartimento di Biochimica e Biologia moleculare
17 Department of Ecology and Evolution
18 Laboratory of Nematology
19 Institute of Evolutionary Biology
20 NC State - North Carolina State University [Raleigh]
21 CIML - Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy
22 CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique
23 UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1
24 School of Biolgical Sciences
25 UBIA - Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (ancêtre de MIAT)
26 WUR - Wageningen University and Research [Wageningen]
Jerome Gouzy
- Fonction : Auteur
- PersonId : 21702
- IdHAL : jerome-gouzy
- ORCID : 0000-0001-5695-4557
- IdRef : 253127092
Jean-Marc Aury
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756899
- IdHAL : jean-marc-aury
- ORCID : 0000-0003-1718-3010
Philippe Castagnone-Sereno
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736028
- IdHAL : philippe-castagnone
- ORCID : 0000-0003-2048-9651
Etienne Danchin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 734755
- IdHAL : danchin-etienne-gj
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- IdRef : 083014454
Laetitia Perfus-Barbeoch
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1202792
François Artiguenave
- Fonction : Auteur
- PersonId : 908642
Marie-Cécile Caillaud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 178907
- IdHAL : marie-cecile-caillaud
- ORCID : 0000-0002-0348-7024
- IdRef : 138024766
Corinne da Silva
- Fonction : Auteur
- PersonId : 908690
- IdHAL : corinne-da-silva
Magali Esquibet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 745702
- IdHAL : magali-esquibet
Timothée Flutre
- Fonction : Auteur
- PersonId : 11756
- IdHAL : timothee-flutre
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- IdRef : 151751773
Olivier Jaillon
- Fonction : Auteur
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Gabriel V Markov
- Fonction : Auteur
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- IdHAL : gabriel-markov
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- IdRef : 155301837
Julie Poulain
- Fonction : Auteur
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- IdHAL : julie-poulain
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- IdRef : 061407232
Erika Sallet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1206052
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Béatrice Ségurens
- Fonction : Auteur
- PersonId : 908637
Delphine Steinbach
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1207148
- ORCID : 0000-0001-7144-7908
Cyril van Ghelder
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1297052
- IdHAL : cyril-van-ghelder
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Bruno Favery
- Fonction : Auteur
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- IdHAL : bruno-favery
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- IdRef : 094617260
Eric Grenier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 740019
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- IdRef : 112881777
Hadi Quesneville
- Fonction : Auteur
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- IdHAL : hadi-quesneville
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- IdRef : 137542860
Marie-Noelle Rosso
- Fonction : Auteur
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Thomas Schiex
- Fonction : Auteur
- PersonId : 734846
- IdHAL : thomas-schiex
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- IdRef : 057033935
Patrick Wincker
- Fonction : Auteur
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- IdHAL : patrick-wincker
- ORCID : 0000-0001-7562-3454
Résumé
Plant-parasitic nematodes are major agricultural pests worldwide and novel approaches to control them are sorely needed. We report the draft genome sequence of the root-knot nematode Meloidogyne incognita, a biotrophic parasite of many crops, including tomato, cotton and coffee. Most of the assembled sequence of this asexually reproducing nematode, totaling 86 Mb, exists in pairs of homologous but divergent segments. This suggests that ancient allelic regions in M. incognita are evolving toward effective haploidy, permitting new mechanisms of adaptation. The number and diversity of plant cell wall-degrading enzymes in M. incognita is unprecedented in any animal for which a genome sequence is available, and may derive from multiple horizontal gene transfers from bacterial sources. Our results provide insights into the adaptations required by metazoans to successfully parasitize immunocompetent plants, and open the way for discovering new antiparasitic strategies