La Zone Atelier Arc Jurassien (ZAAJ) a vocation à favoriser les recherches interdisciplinaires à long terme sur l’environnement et les écosystèmes, en relation avec les questions sociétales, en s’appuyant sur des dispositifs d’observation à long terme, à l’interface entre écologie, environnement et société. La conception de ces dispositifs et l’analyse des données collectées posent des questions de recherche résolues par des collaborations entre biologistes, mathématiciens et informaticiens. Nous présentons ici le cadre et quelques exemples de ces collaborations.