Ce rapport se propose d'interroger les degrés de vulnérabilité de La Réunion et de Mayotte, et d'une façon plus générale les états du sud-ouest de l'océan Indien, face aux maladies émergentes. En dépit de leur statut français et européen ces deux territoires restent au coeur d’une zone géographique, le sud-ouest de l'océan Indien, économiquement et sanitairement sensible. L’objectif général du projet qui préside à ce rapport est une meilleure compréhension globale des facteurs d’émergence des maladies infectieuses. Le projet se situe à la croisée de plusieurs problématiques de recherche très présentes dans le débat public mais insuffisamment explorées d’un point de vue scientifique dans le champ des sciences de l’homme et de la société. Risques sanitaires, gestion des crises, émergence des maladies infectieuses et vulnérabilité des sociétés sont donc croisés dans une démarche transdisciplinaire structurée selon deux axes de recherche.