L'analyse conjointe cherche à expliquer une variable qualitative ordinale en fonction de plusieurs variables qualitatives moyennant une régression multiple par interviewé. Elle se trouve handicapée lorsque certains classements sont manquants. Nous nous intéressons donc dans cet article aux cas où la variable à expliquer présente un ordre partiel uniquement. Nous proposons ici une procédure d'estimation des valeurs manquantes, et montrons sur un exemple que si le nombre de ces dernières n'est pas trop élevé les données restent utilisables, et les résultats proches de ceux de l'ordre complet. Nous confirmons ces résultats par simulation.