Breast cancer and quality of life: medical information extraction from health forums
Thomas Opitz
(1, 2)
,
Jérôme Azé
(3, 4, 5)
,
Sandra Bringay
(5, 6)
,
Cyrille Joutard
(1)
,
Christian Lavergne
(1)
,
Caroline Mollevi
(7, 8)
1
I3M -
Institut de Mathématiques et de Modélisation de Montpellier
2 LIRMM - Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier
3 AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology
4 LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique
5 ADVANSE - ADVanced Analytics for data SciencE
6 UPVM - Université Paul-Valéry - Montpellier 3
7 Unité de biostatistiques
8 UNICANCER
2 LIRMM - Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier
3 AMIB - Algorithms and Models for Integrative Biology
4 LRI - Laboratoire de Recherche en Informatique
5 ADVANSE - ADVanced Analytics for data SciencE
6 UPVM - Université Paul-Valéry - Montpellier 3
7 Unité de biostatistiques
8 UNICANCER
Thomas Opitz
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Jérôme Azé
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- IdHAL : jerome-aze
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Sandra Bringay
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- IdHAL : sandra-bringay
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Cyrille Joutard
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- IdHAL : cyrille-joutard
Christian Lavergne
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Caroline Mollevi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 751492
- IdHAL : caroline-mollevi
- ORCID : 0000-0003-4827-3684
Résumé
Internet health forums are a rich textual resource with content generated through free exchanges among patients and, in certain cases, health professionals. We tackle the problem of retrieving clinically relevant information from such forums, with relevant topics being defined from clinical auto-questionnaires. Texts in forums are largely unstructured and noisy, calling for adapted preprocessing and query methods. We minimize the number of false negatives in queries by using a synonym tool to achieve query expansion of initial topic keywords. To avoid false positives, we propose a new measure based on a statistical comparison of frequent co-occurrences in a large reference corpus (Web) to keep only relevant expansions. Our work is motivated by a study of breast cancer patients' health-related quality of life (QoL). We consider topics defined from a breast-cancer specific QoL-questionnaire. We quantify and structure occurrences in posts of a specialized French forum and outline important future developments.
Format du dépôt | Fichier |
---|---|
Type de dépôt | Communication dans un congrès |
Résumé |
en
Internet health forums are a rich textual resource with content generated through free exchanges among patients and, in certain cases, health professionals. We tackle the problem of retrieving clinically relevant information from such forums, with relevant topics being defined from clinical auto-questionnaires. Texts in forums are largely unstructured and noisy, calling for adapted preprocessing and query methods. We minimize the number of false negatives in queries by using a synonym tool to achieve query expansion of initial topic keywords. To avoid false positives, we propose a new measure based on a statistical comparison of frequent co-occurrences in a large reference corpus (Web) to keep only relevant expansions. Our work is motivated by a study of breast cancer patients' health-related quality of life (QoL). We consider topics defined from a breast-cancer specific QoL-questionnaire. We quantify and structure occurrences in posts of a specialized French forum and outline important future developments.
|
Titre |
en
Breast cancer and quality of life: medical information extraction from health forums
|
Auteur(s) |
Thomas Opitz
1, 2
, Jérôme Azé
3, 4, 5
, Sandra Bringay
5, 6
, Cyrille Joutard
1
, Christian Lavergne
1
, Caroline Mollevi
7, 8
1
I3M -
Institut de Mathématiques et de Modélisation de Montpellier
( 631 )
- Case Courrier 051 Place Eugène Bataillon 34095 MONTPELLIER CEDEX 5
- France
2
LIRMM -
Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier
( 181 )
- 161 rue Ada - 34095 Montpellier
- France
3
AMIB -
Algorithms and Models for Integrative Biology
( 103784 )
- Algorithmes et modèles pour la Biologie Intégrative
Bâtiment Alan Turing - Campus de l'École Polytechnique - 1 rue Honoré d'Estienne d'Orves - 91120 Palaiseau
- France
4
LRI -
Laboratoire de Recherche en Informatique
( 2544 )
- LRI - Bâtiments 650-660 Université Paris-Sud 91405 Orsay Cedex
- France
5
ADVANSE -
ADVanced Analytics for data SciencE
( 409262 )
- LIRMM, 161 rue Ada, 34000 Montpellier
- France
6
UPVM -
Université Paul-Valéry - Montpellier 3
( 42812 )
- Université Paul Valéry Montpellier 3
Route de Mende
34199 Montpellier Cedex 5
- France
7
Unité de biostatistiques
( 37452 )
- 208 rue des Apothicaires, 34298 Montpellier Cedex 5
- France
8
UNICANCER
( 502406 )
- 101, rue de Tolbiac, 75654 Paris Cedex 13
- France
|
Public visé |
Scientifique
|
ISSN |
0926-9630
|
Comité de lecture |
Oui
|
Vulgarisation |
Non
|
Invité |
Non
|
Pays |
Turquie
|
Ville |
Istanbul
|
Titre du congrès |
25th European Medical Informatics Conference (MIE)
|
Date fin congrès |
2014-09-03
|
Date début congrès |
2014-08-31
|
Page/Identifiant |
1070-1074
|
Date de publication |
2014-08-28
|
Langue du document |
Anglais
|
Date de production/écriture |
2014-02
|
Audience |
Internationale
|
Actes |
Oui
|
Licence |
Paternité - Pas d'utilisation commerciale
|
Titre de la collection |
Studies in Health Technology and Informatics
|
Volume |
20
|
Numéro |
205
|
Indexation contrôlée |
|
Domaine(s) |
|
Financement |
|
Mots-clés |
en
quality of life study, query expansion, social media, text mining, breast cancer
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DOI | 10.3233/978-1-61499-432-9-1070 |
ProdINRA | 311680 |
Origine :
Fichiers produits par l'(les) auteur(s)
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