Le Jura a donné son nom au système jurassique (-200 à -145 millions d'années). Il est caractérisé par la puissance de ses calcaires, séparés par des séries marneuses. La dissolution des roches calcaires fracturées produit un relief particulier : le karst. Dans ces fractures, l'eau d'infiltration alimente des nappes drainées par des conduits karstiques aboutissant à de grandes sources. La circulation rapide depuis la surface implique une recharge facile, mais aussi une grande vulnérabilité de ces ressources. De nombreuses agglomérations utilisent cette ressource en eau destinée à la consommation humaine avec un mode de protection adapté à cette vulnérabilité. Si l'exploitation et la protection des eaux karstiques sont soumises à des conditions propres à ce milieu, les travaux d'infrastructure et d'aménagement sont également dépendants de l'hétérogénéité du karst.