URGI genome annotation system:an integrated system for structural and functional genome annotation - Archive ouverte HAL
Communication Dans Un Congrès Année : 2011

URGI genome annotation system:an integrated system for structural and functional genome annotation

Michael Alaux
Nathalie Choisne
Nicolas Lapalu
Aminah A. Keliet
Erik Kimmel
Françoise Alfama
Cyril Pommier
Delphine Steinbach
Hadi Quesneville

Résumé

The URGI platform (http://urgi.versailles.inra.fr) develops a genome annotation system dedicated to plants and their pathogens. This Integrated System relies on: (i) pipelines for Transposable Elements annotation (REPET) and gene structural and functional predictions (ii) databases and user-friendly interfaces to browse and query the data (URGI Information System GnpIS, Genome Report System GRS), (iii) A distributed annotation system for curation of gene structure.
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Dates et versions

hal-01019754 , version 1 (06-06-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-01019754 , version 1
  • PRODINRA : 46104

Citer

Joelle J. Amselem, Michael Alaux, Nathalie Choisne, Nicolas Lapalu, Baptiste Brault, et al.. URGI genome annotation system:an integrated system for structural and functional genome annotation. 12. Edition du colloque JOBIM : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jun 2011, Paris, France. 2 p. ⟨hal-01019754⟩
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