Principes de base de la sélection génomique - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue INRA Productions Animales Année : 2011

Principes de base de la sélection génomique

Résumé

Avec l'arrivée de données de génotypage à haut débit, il est maintenant possible d'estimer la valeur génétique d'animaux candidats à la sélection dès leur naissance, sans attendre la collecte de phénotypes. La sélection génomique bouleverse complètement les perspectivesen amélioration génétique. Elle nécessite la constitution d'une population de référence formée d'animaux génotypés (jusqu'à récemment, il s'agissait principalement de mâles) et ayant des performances précises, par exemple la performance moyenne de leurs filles. Les évaluations génomiques consistent à prédire les phénotypes dans cette population de référence comme la somme des effets des marqueurs moléculaires. Le problème méthodologique principal est que le nombre d'effets à estimer est typiquement beaucoup plus élevé que le nombre de phénotypes disponibles. Nous décrivons les idées générales de diverses familles de méthodes proposées : BLUP génomique basé sur une parenté entre individus calculée à partir des marqueurs, méthodes Bayésiennes plus flexibles mais aussi plus coûteuses, méthodes de sélection de variables, méthode en une seule étape qui combine évaluation génétique nationale et évaluation génomique. La précision des évaluations génomiques est faite par validation croisée chez les animaux les plus jeunes de la population de référence. La taille de la population de référence, la manière de prendre en compte les QTL à effet fort et le degré d'apparentement entre candidats à la sélection et animaux de la population de référence ont un impact non négligeable sur l'efficacité desméthodes de sélection génomique.
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Dates et versions

hal-01000275 , version 1 (28-05-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-01000275 , version 1
  • PRODINRA : 163012
  • WOS : 000299191400006

Citer

Christèle Robert-Granié, Andres Legarra, Vincent Ducrocq. Principes de base de la sélection génomique. INRA Productions Animales, 2011, 24 (4), pp.331-340. ⟨hal-01000275⟩
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