Application du problème de caractérisation multiple à la conception de tests de diagnostic pour la biologie végétale - Archive ouverte HAL Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série RIA : Revue d'Intelligence Artificielle Année : 2013

Application du problème de caractérisation multiple à la conception de tests de diagnostic pour la biologie végétale

Résumé

In this paper, we address a characterization problem coming from plant biology. The multiple characterization problem consists of entities (represented by Boolean assignments) belonging to several groups, and the goal is to find a characterization for each group using propositional logic. This characterization must be exact and the main difficulty is to compute the minimal one. We show that this problem is W[2]-Complete. We also propose a reformulation to a linear program and describe different approaches for its resolution. We experiment on random and real instances whose solutions are used to design a patent-protected diagnostic test.
Dans cet article, nous présentons un problème de caractérisation issu de la biologie végétale. Ce problème de caractérisation multiple consiste à traiter simultanément plusieurs groupes d'entités (représentées par des interprétations booléennes) et à trouver une caractérisation pour chacun d'eux sous forme de formules booléennes. Cette caractérisation doit être exacte et une des difficultés majeures est de trouver une caractérisation minimale. Une étude de complexité de ce problème est réalisée et nous arrivons à la conclusion que le problème est W[2]-Complet. Nous proposons une reformulation du problème en programmation linéaire ainsi que différentes approches de résolutions. Une étude expérimentale est réalisée sur des instances aléatoires ainsi que des instances réelles. Les résultats obtenus sur ces dernières ont pu être valorisés par le dépôt d'un brevet et la validation au niveau européen d'un test de dépistage basé sur les caractérisations trouvées.
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Dates et versions

hal-00951297 , version 1 (24-02-2014)

Identifiants

  • HAL Id : hal-00951297 , version 1

Citer

Fabien Chhel, Frédéric Lardeux, Frédéric Saubion, Bruno Zanuttini. Application du problème de caractérisation multiple à la conception de tests de diagnostic pour la biologie végétale. Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série RIA : Revue d'Intelligence Artificielle, 2013, pp.649-668. ⟨hal-00951297⟩
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