Predicting observed and latent responses to BLUP selection involving logistic variates
Résumé
Multivariate BLUPs can be derived when data are a mixture of continuous traits and observed discrete traits controlled by logistic latent traits. Algorithms were developed for predicting discrete responses to BLUP selection, and latent responses when the selection process included additional culling on scores. These algorithms were Taylor expansions using well-known expressions such as the probabilities and the two first moments of the truncated multinormal distribution, after appropriate re-parametrizations. They were compared to very accurate quadrature integrations. The test examples were suggested by a situation found in chickens where selection can involve body weight and leg deformity described by two logistic latent variates. Quadratic Taylor expansions generally provided a good accuracy. Therefore, they could be recommended when quadrature methods are too demanding, e.g., for complex breeding schemes.
Prédiction des réponses observées et sous-jacentes à la sélection sur le BLUP. On peut calculer des BLUPs à partir de données mélangeant des caractères continus et des caractères discrets contrôlés par des variables logistiques. On développe des algorithmes de prédiction des réponses discrètes à la sélection sur le BLUP. De même, on cherche à prédire les réponses sur les variables latentes quand le processus de sélection inclut une sélection directe sur les variables discrètes en plus de la sélection sur le BLUP. Ces algorithmes sont des développements de Taylor qui utilisent des expressions bien connues, telles que la probabilité et les deux premiers moments d'une distribution multinormale tronquée, après modification appropriée des paramètres. Ils sont comparés à des quadratures numériques très précises. Les exemples de test proviennent d'une situation rencontrée en sélection avicole où la sélection peut impliquer le poids corporel et les déformations des pattes, décrites par deux variables latentes logistiques. Les développements de Taylor du second degré sont généralement précis. Par conséquent, ils pourraient être utilisés quand les méthodes de résolution par quadratures sont trop exigeantes en temps de calcul.
Domaines
Génétique animale| Origine | Accord explicite pour ce dépôt |
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