Le CCNE a produit un ensemble de positions spécifiquement centrées sur les méthodologies de la recherche sur l'être humain: les méthodologies propres à garantir une recherche "scientifiquement correcte" et les tensions éthiques qui peuvent découler de cette exigence de bonne science sont traitées à l'avis fondamental (et fondateur) n° 2 sur les essais de nouveaux traitements chez l'homme (1984), auxquels répondent les avis n° 32 sur la méthodologie de test du centoxin, 34 sur l'utilisation de placebos dans les essais thérapeutiques d'antidépresseurs (1993) et 73 sur les essais de phase I en cancérologie (2002). Ces avis sont analysés et commentés.