Lorsque l'on modélise des systèmes complexes, il est souvent nécessaire de considérer des entités à plusieurs niveaux d'organisation et niveaux d'échelles. La prise en compte de ces niveaux, de leurs influences réciproques, et des dynamiques d'organisation aux interfaces entre eux, est un problème ardu pour lequel les solutions proposées sont souvent liées à une discipline ou à un cas d'étude particulier. Pour essayer d'aller vers une méthodologie plus générale de conception de modèles multiniveaux, nous proposons une grille d'analyse des approches utilisées, élaborée notamment à partir de l'étude de trois exemples en biologie et en géographie. Nous montrons ensuite, dans le cadre d'un exemple unificateur, comment différentes approches peuvent être combinées.